CASC3

CASC3
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, BTZ, MLN51, cancerkänslighetskandidat 3, cancerkänslighet 3, exonövergångskomplex subenhet, CASC3 exonövergångskomplex subenhet
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Protein CASC3 är ett protein som hos människor kodas av CASC3 -genen .

Fungera

Produkten av denna gen är en kärnkomponent i exon junction complex (EJC), ett proteinkomplex som deponeras på splitsade mRNA vid exon-exon junctions och fungerar i nonsens-medierat mRNA decay (NMD). Det kodade proteinet binder RNA och interagerar med två andra EJC-kärnkomponenter. Det är övervägande lokaliserat i cytoplasman , men skjuts in i kärnan där det lokaliseras till kärnfläckar .

externa länkar

• Mänskligt CASC3- genomplacering och CASC3- geninformationssida i UCSC Genome Browser .

Vidare läsning

•   Varis A, Wolf M, Monni O, et al. (2002). "Mål för genamplifiering och överuttryck vid 17q i magcancer". Cancer Res . 62 (9): 2625–9. PMID 11980659 .
•   Degot S, Régnier CH, Wendling C, et al. (2002). "Metastatisk lymfkörtel 51, ett nytt nukleo-cytoplasmatiskt protein överuttryckt i bröstcancer" . Onkogen . 21 (28): 4422–34. doi : 10.1038/sj.onc.1205611 . PMID 12080473 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•    Macchi P, Kroening S, Palacios IM, et al. (2003). "Barentsz, en ny komponent i de Staufen-innehållande ribonukleoproteinpartiklarna i däggdjursceller, interagerar med Staufen på ett RNA-beroende sätt" . J. Neurosci . 23 (13): 5778–88. doi : 10.1523/jneurosci.23-13-05778.2003 . PMC 6741274 . PMID 12843282 .
•   Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 humana cDNAs i full längd" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
•    Palacios IM, Gatfield D, St Johnston D, Izaurralde E (2004). "Ett eIF4AIII-innehållande komplex som krävs för mRNA-lokalisering och nonsensmedierad mRNA-sönderfall". Naturen . 427 (6976): 753–7. Bibcode : 2004Natur.427..753P . doi : 10.1038/nature02351 . PMID 14973490 . S2CID 4400243 .
•   Degot S, Le Hir H, Alpy F, et al. (2004). "Association av bröstcancerproteinet MLN51 med exon junction-komplexet via dess fläcklokaliserare och RNA-bindningsmodul" . J. Biol. Chem . 279 (32): 33702–15. doi : 10.1074/jbc.M402754200 . PMID 15166247 .
•    Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
•    Kim YK, Furic L, Desgroseillers L, Maquat LE (2005). "Däggdjur Staufen1 rekryterar Upf1 till specifika mRNA 3'UTRs för att framkalla mRNA-sönderfall" . Cell . 120 (2): 195–208. doi : 10.1016/j.cell.2004.11.050 . PMID 15680326 . S2CID 16786108 .
•    Ballut L, Marchadier B, Baguet A, et al. (2005). "Exon junction core-komplexet är låst till RNA genom hämning av eIF4AIII ATPas-aktivitet". Nat. Struktur. Mol. Biol . 12 (10): 861–9. doi : 10.1038/nsmb990 . PMID 16170325 . S2CID 1359792 .
•    Tange TØ, Shibuya T, Jurica MS, Moore MJ (2006). "Biokemisk analys av EJC avslöjar två nya faktorer och en stabil tetramer proteinkärna" . RNA . 11 (12): 1869–83. doi : 10.1261/rna.2155905 . PMC 1370875 . PMID 16314458 .
•    Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversifiering av transkriptionsmodulering: storskalig identifiering och karakterisering av förmodade alternativa promotorer av mänskliga gener" . Genome Res . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
•    Shibuya T, Tange TØ, Stroupe ME, Moore MJ (2006). "Mutationsanalys av humant eIF4AIII identifierar regioner som är nödvändiga för bildning av exonövergångskomplex och nonsensmedierad mRNA-nedbrytning" . RNA . 12 (3): 360–74. doi : 10.1261/rna.2190706 . PMC 1383576 . PMID 16495234 .
•    Andersen CB, Ballut L, Johansen JS, et al. (2006). "Struktur av exonövergångskärnkomplexet med ett fångat DEAD-box ATPase bundet till RNA". Vetenskap . 313 (5795): 1968–72. Bibcode : 2006Sci...313.1968A . doi : 10.1126/science.1131981 . PMID 16931718 . S2CID 26409491 .
•    Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). "Global, in vivo och platsspecifik fosforyleringsdynamik i signalnätverk" . Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
•   Baguet A, Degot S, Cougot N, et al. (2007). "Exon-övergången-komplex-komponenten metastaserande lymfkörtel 51 fungerar i stress-granula montering" . J. Cell Sci . 120 (Pt 16): 2774–84. doi : 10.1242/jcs.009225 . PMID 17652158 .