BTBD1

BTBD1-
identifierare
	, C15orf1, NS5ATP8, BTB-domän som innehåller 1
externt ID
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

BTB/POZ-domäninnehållande protein 1 är ett protein som hos människor kodas av BTBD1 -genen .

Fungera

C-terminalen av proteinet som kodas av denna gen binder topoisomeras I. N-terminalen innehåller en prolinrik region och en BTB/POZ-domän (bredkomplex, Tramtrack och bric a brac/pox-virus och zinkfinger), båda av vilka vanligtvis är involverade i protein-protein-interaktioner. Subcellulärt lokaliseras proteinet till cytoplasmatiska kroppar. Alternativ splitsning resulterar i flera transkriptvarianter som kodar för olika isoformer.

Interaktioner

BTBD1 har visat sig interagera med TOP1 .

externa länkar

Mänskligt BTBD1- genomplacering och BTBD1- geninformationssida i UCSC Genome Browser .

Vidare läsning

Maruyama K, Sugano S (januari 1994). "Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (okt 1997). "Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändsanrikat cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, Briones MR, Nagai MA, da Silva W, Zago MA, Bordin S, Costa FF, Goldman GH, Carvalho AF, Matsukuma A, Baia GS, Simpson DH, Brunstein A, de Oliveira PS, Bucher P, Jongeneel CV, O'Hare MJ, Soares F, Brentani RR, Reis LF, de Souza SJ, Simpson AJ (mars 2000). "Hagelgevärssekvensering av det mänskliga transkriptomet med ORF-uttryckta sekvenstaggar" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (7): 3491–6. Bibcode : 2000PNAS...97.3491D . doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC 16267 . PMID 10737800 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (november 2000). "DNA-kloning med användning av platsspecifik rekombination in vitro" . Genomforskning . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Carim-Todd L, Sumoy L, Andreu N, Estivill X, Escarceller M (Jan 2001). "Identifiering och karakterisering av BTBD1, en ny BTB-domän innehållande gen på human kromosom 15q24". Gene . 262 (1–2): 275–81. doi : 10.1016/S0378-1119(00)00513-8 . PMID 11179693 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (mars 2001). "Mot en katalog av mänskliga gener och proteiner: sekvensering och analys av 500 nya kompletta proteinkodande humana cDNAs" . Genomforskning . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (september 2000). "Systematisk subcellulär lokalisering av nya proteiner identifierade genom storskalig cDNA-sekvensering" . EMBO-rapporter . 1 (3): 287–92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
Xu L, Yang L, Hashimoto K, Anderson M, Kohlhagen G, Pommier Y, D'Arpa P (2003). "Karakterisering av BTBD1 och BTBD2, två liknande BTB-domäninnehållande Kelch-liknande proteiner som interagerar med Topoisomeras I" . BMC Genomics . 3 : 1. doi : 10.1186/1471-2164-3-1 . PMC 64781 . PMID 11818025 .
Xu L, Yang L, Moitra PK, Hashimoto K, Rallabhandi P, Kaul S, Meroni G, Jensen JP, Weissman AM, D'Arpa P (augusti 2003). "BTBD1 och BTBD2 kolokaliserar till cytoplasmatiska kroppar med RBCC/trepartsmotivproteinet, TRIM5delta". Experimentell cellforskning . 288 (1): 84–93. doi : 10.1016/S0014-4827(03)00187-3 . PMID 12878161 .
Pisani DF, Cabane C, Derijard B, Dechesne CA (november 2004). "Det topoisomeras 1-interagerande proteinet BTBD1 är viktigt för muskelcellsdifferentiering" ( PDF) . Celldöd och differentiering . 11 (11): 1157–65. doi : 10.1038/sj.cdd.4401479 . PMID 15486563 . S2CID 33142531 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (okt 2004). "Från ORFeome till biologi: en funktionell genomikpipeline" . Genomforskning . 14 (10B): 2136–44. doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (Jan 2006). "LIFEdb-databasen 2006" . Nukleinsyraforskning . 34 (Databasproblem): D415–8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .