BP holin familj

Familjen β-proteobakteriella holin (BP-Hol) ( TC# 1.E.50) är en liten familj som inkluderar medlemmar som härrör från ett antal Burkholderia - fager såväl som en Poloromonas -art. Från och med den 3 april 2016 tillhör denna familj Holin-superfamiljen II . Medlemmar av Saier Bioinformatics Lab vid University of California, San Diego fann att BP-Hol-familjen är närmast besläktad med T7-holinfamiljen ( TC# 1.E.6) . Dessa proteiner har en längd på 60 till 110 aminoacylrester (aas) och uppvisar 1 eller 2 transmembransegment (TMS). Vissa är annoterade som typ II-holliner och kan vara relaterade till medlemmar av T7 Holin-familjen ( TC# 1.E.6 ), även om BP-Hol-proteiner förblir funktionellt okarakteriserade. En representativ lista över de proteiner som tillhör familjen BP-Hol finns i Transporter Classification Database .

Se även

• Holin
• Lysin
• Databas för klassificering av transportörer

Vidare läsning

• "BcepMigl_gp72 - Holin - Burkholderia fag BcepMigl - BcepMigl_gp72 gen & protein" . www.uniprot.org . Hämtad 2016-03-29.
•      Gründling, Angelika; Manson, Michael D.; Young, Ry (2001-07-31). "Holins dödar utan förvarning" . Proceedings of the National Academy of Sciences 98 (16): 9348–9352. doi : 10.1073/pnas.151247598 . ISSN 0027-8424 . PMC 55423 . PMID 11459934 .
•     Preston, Gail M.; Studholme, David J.; Caldelari, Isabelle (2005-04-01). "Profilering av sekretomen från växtpatogena proteobakterier" . FEMS Microbiology Reviews 29 (2): 331–360. doi : 10.1016/j.fmrre.2005.01.001 . ISSN 1574-6976 . PMID 15808747 .
•     Reddy, Bhaskara L.; Saier Jr., Milton H. (2013-11-01). "Topologiska och fylogenetiska analyser av bakteriella holinfamiljer och superfamiljer" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes 1828 (11): 2654–2671. doi : 10.1016/j.bbamem.2013.07.004 . PMC 3788059 . PMID 23856191 .
•      Saier, Milton H.; Reddy, Bhaskara L. (2015-01-01). "Holins i bakterier, eukaryoter och arkéer: multifunktionella xenologer med potentiella bioteknologiska och biomedicinska tillämpningar" . Journal of Bacteriology 197 (1): 7–17. doi : 10.1128/JB.02046-14 . ISSN 0021-9193 . PMC 4288690 . PMID 25157079 .
•     Wang, IN; Smith, DL; Young, R. (2000-01-01). "Holins: proteinklockorna för bakteriofaginfektioner" . Annual Review of Microbiology 54 : 799–825. doi : 10.1146/annurev.micro.54.1.799 . ISSN 0066-4227 . PMID 11018145 .

Från och med denna redigering använder den här artikeln innehåll från "1.E.50. The β-Proteobacterial Holin (BP-Hol) Family" , som är licensierad på ett sätt som tillåter återanvändning under Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , men inte under GFDL . Alla relevanta villkor måste följas.