Avibirnavirus
|
|
| Avibirnavirus | |
|---|---|
| Infektiös bursal sjukdom viruspartikel | |
| Virusklassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Riboviria |
| Rike: | Orthornavirae |
| Provins: | incertae sedis |
| Familj: | Birnaviridae |
| Släkte: | Avibirnavirus |
| Art | |
Avibirnavirus är ett släkte av virus i familjen Birnaviridae . Det finns en enda art i detta släkte: Infectious bursal disease virus , som infekterar kycklingar och andra höns. Det orsakar allvarlig inflammation i bursa av Fabricius och orsakar betydande sjuklighet och dödlighet.
Historia
Till en början upptäcktes viruset 1957 i Gumboro , Delaware , USA . Senare kallades sjukdomen Gumboros sjukdom . Sedan dess upptäckt har viruset visat sig ha en världsomspännande spridning.
Strukturera
Avibirnavirus är icke-hölje, och deras enkelskaliga ikosaedriska kapsid uppvisar en T=13-symmetri. Kapsidens diameter är cirka 70 nm.
| Släkte | Strukturera | Symmetri | Capsid | Genomiskt arrangemang | Genomisk segmentering |
|---|---|---|---|---|---|
| Avibirnavirus | Icosahedral | T=13 | Ej kuverterade | Linjär | Segmenterad |
Genom
Det dubbelsträngade RNA-genomet av Avibirnavirus är linjärt och segmenterat i två segment (A och B). De kombinerade längderna av de två segmenten är cirka 6 000 nukleotider, nästan helt sammansatta av läsramar. Genomet kodar för 4-5 proteiner beroende på stam. Den höga graden av antigen variation beror på en kombination av hög mutationshastighet och homolog rekombination mellan stammar inom en hypervariabel region som är belägen i vp2 -genen.
Med en längd på cirka 3 200 bp är segment A det största av de två segmenten. Den innehåller två delvis överlappande öppna läsramar (ORF). Den första ORF:en i segment A kodar för viralt protein 5 (VP5). Den andra ORF:en i segment A kodar för ett polyprotein , pVP2-VP4-VP3-prekursorn, som klyvs till tre proteiner. Segment B kodar för ett enda viralt protein, VP1.
Virala proteiner
VP1
Viralt protein 1 är ett RNA-beroende RNA-polymeras , som cirkulerar mellan de två segmenten och hjälper till att bilda ribonukleoproteinkomplex med viralt protein 3.
VP2
Viralt protein 2 är en viktig strukturell komponent i virionen. Proteinet innehåller tre domäner: bas, skal och projektion. Projektionsdomänen består av fyra slingstrukturer som är exponerade på virionytan . Detta protein är ansvarigt för att inducera ett skyddande immunsvar, som neutraliserar monoklonala antikroppar genom att binda till projektdomänen. Det virala proteinet tillsammans med VP5 fungerar som en apoptotisk inducerare, vilket gör att påverkade celler blir cytotoxiska. Tillsammans med VP5 hämmar det också cellulär proteinsyntes genom aktivering av proteinkinas R-vägen (PKR). Denna aktivering leder till en ökning av reaktiva syreämnen i de drabbade cellerna.
VP3
Viralt protein 3 är ett immunogent protein som interagerar med VP1. Det hjälper till att reglera VP2-apoptos genom att hämma fosforylering av PKR och eukaryot initieringsfaktor 2 (eIF2). Apoptotisk reglering möjliggör replikering och frisättning av viruset till andra celler.
VP4
Viralt protein 4 är ett serinproteas, som katalyserar hydrolysen av polyprotein pVP2-VP4-VP3 för att frigöra de virala proteinerna. Serinproteaset som klyver vid ser-652 och lys-692. Detta steg är väsentligt för replikering på grund av frisättning av de andra proteinerna. VP4 kommer dessutom att ta över ett glukokortikoid-inducerat leucin blixtlåsprotein (GILZ) som kommer att möjliggöra viral tillväxt och blockera värdcellens immunsvar.
VP5
Viralt protein 5 är en inducerare av apoptos för DF-1-celler. Den förlitar sig på att hämma den spänningsberoende anjonkanalen 2 (VDCA2) som ligger på mitokondrierna. Hämningen kommer att underlättas av VP2, som kommer att stänga kanalen och möjliggöra spridning av viruset i värdceller. Dessutom kommer VDCA2 att binda till RACK1 som tillåter replikering.
Serotypning
Virusets serotyp och antigena variationer kan endast särskiljas genom virusneutraliseringsanalyser. Projektdomänerna kan ses för att se virusets variation genom aminosyrasubstitutioner. Genomet är vanligtvis mycket konserverat, men serotyperna kommer att variera genomet på grund av nukleotidförändringar. Det finns två serotyper av avibirnavirus varav en innehåller flera klassificeringar. Serotyp 1 är patogen för kycklingar, särskilt vid 3 till 6 veckors ålder och ses vara mer virulent hos lättare raser. Denna serotyp innehåller tre huvudklassificeringar: klassisk virulent IBDV, mycket virulent IBDV och variant IBDV. Klassisk virulent IBDV är den enda serotypen som har två subtyper: försvagat vaccin IBDV och klassiskt virulent IBDV. Även om dessa serotyper kan variera beroende på region. Serotyp 2 identifierades i kalkon. Denna serotyp har ingen patogen effekt på kycklingar.
Livscykel
Viral replikation är cytoplasmatisk. Inträde i värdcellen uppnås genom penetration in i värdcellen. Ingångspunkterna i värdcellen är genom vissa cellreceptorer. En receptor som viruset kommer att binda är ytimmunoglobulin M, som specifikt interagerar med antikroppens lätta kedjor. En annan receptor som kan bindas är värmechockprotein 90 (HSP90) på ytan av DF-1-cellmembranet. Även om denna receptor binder antingen viruset eller den VP2-virala subpartikeln. Inträde genom membranet har inte förståtts helt. Genomträngningen av membranet underlättas av kapsiden PEP46. Kapiden kommer att ha en peptid genererad från c-terminalen av pVP2 som frisätts av VP4. Peptiden gör att membranet blir permeabelt genom att bilda porer, vilket möjliggör PEP46-inträde beroende på kalciumgradient. Om den inre kalciumgradienten är låg, tros den komma in i V-ATPas-positiva vesiklar genom endocytos och obelagd för inträde i cytosolen. Det har också visat sig att VP2-α4β1 hjälper till att sprida viruset i cellen också genom makropinocytos . Detta kommer att göra det möjligt för viruset att flyttas till de tidiga endosomerna som åstadkoms i cellen genom Rab5. Replikationen följer den dubbelsträngade RNA-virusreplikationsmodellen. Dubbelsträngad rna-virustranskription är metoden för transkription. Unga höns och andra höns tjänar som den naturliga värd. Överföringsvägar är föroreningar.
| Släkte | Värdinformation | Vävnadstropism | Inträdesuppgifter | Releaseinformation | Replikeringsplats | Monteringsplats | Överföring |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Avibirnavirus | Fåglar | Ingen | Cellreceptorendocytos | Gryende | Cytoplasma | Cytoplasma | Kontakt |