Antimycin
Antimyciner produceras som sekundära metaboliter av Streptomyces -bakterier, en jordbakterie. Dessa specialiserade metaboliter fungerar sannolikt för att döda närliggande organismer för att ge streptomyces-bakterierna en konkurrensfördel.
Kemiska strukturer
Biosyntes
Antimyciner produceras av ett icke-ribosomalt peptidsyntetas (NRPS)/polyketidsyntas (PKS)-sammansättningskomplex som fungerar som ett monteringsband för antimycinproduktion. Sammansättningen är genetiskt kodad av myrgenfamiljen. Sammansättningen kräver 14 proteiner, AntBCDEFGHIJKLMNO, som transporterar mellanprodukterna längs löpande bandet genom en serie transesterifieringar , keto-reduktioner , tioleringar (tillsats av en svavelinnehållande grupp), kondensationer och adenyleringar . De två sista stegen som involverar AntB och AntO är skräddarsydda steg. Följande steg beskriver kemiskt vad myranzymer gör för att syntetisera antimycin. Syntesen börjar med tryptofan, en aminosyra.
1. Indolringen av tryptofan, en aminosyra, öppnas av ett vägspecifikt tryptofan-2.3-dioxygneas, AntN, för att göra N-formyl-L-kynurenin.
2. N-formyl-L-kynurenin omvandlas till antranilat av det vägspecifika kynureninaset , AntP.
3. Antranilat aktiveras av acyl-CoA- ligasproteinet , AntF och laddas på dess besläktade bärarprotein, AntG, för vidare bearbetning.
4. Antranilat omvandlas till 3-aminosalicylat av ett multikomponent oxygenas , AntHIJKL.
5. 3-aminosalicylat presenteras för NRPS, AntC. AntC har två moduler som är organiserade Kondensation1 (C1) -Adenylation1 (A1) -Tiolation1 (T1) -Kondensation2 (C2) -Adenylation2 (A2) -Ketoreduktion (KR) -Tiolation2 (T2). A1-domänen aktiverar och laddar treonin, en aminosyra, på T1, följt av en C1-främjad kondensation av 3-aminosalicylat och treonin. A2-domänen aktiverar och laddar pyruvat på T2. Pyruvat reduceras av KR-domänen och kondenseras med treonin av C2
6. Ketosyntas -domänen av PKS katalyserar den dekarboxylativa kondensationen mellan aminoacyltioestern bunden till AntC T2-domänen och 2-karboxi-acyldelen bunden till AntD Acetyl Carrier Protein-domänen.
7. AntM katalyserar reduktionen av β-ketogruppen, som föregår AntD TE-domänen – främjad frisättning av den nio-ledade dilaktonen
8. En lipashomolog, AntO, och acyltransferashomolog , AntB, katalyserar installationen av N-formylgruppen respektive transesterifieringen av C-8-hydroxylgruppen, vilket resulterar i ryggraden för Antimycinfamiljen.