Anpassad peptidsyntes
Anpassad peptidsyntes är kommersiell produktion av peptider för användning inom biokemi , biologi, bioteknik, farmakologi och molekylär medicin . Anpassad peptidsyntes tillhandahåller syntetiska peptider som värdefulla verktyg till biomedicinska laboratorier. Syntetiska oligopeptider används i stor utsträckning i forskning för struktur-funktionsanalys (till exempel för att studera protein-protein-gränssnitt), för utveckling av bindningsanalyser, studie av receptoragonister/antagonister eller som immunogener för produktion av specifika antikroppar. Generellt syntetiseras peptider genom att koppla karboxylgruppen eller C-terminalen av en aminosyra till aminogruppen eller N-terminalen av en annan genom att använda automatiserade fastfas-peptidsynteskemi. Vätskefassyntes kan emellertid också användas för specifika behov.
Automatiserad fastfaspolypeptidsyntes
Storskalig anpassad peptidsyntes kan utföras antingen i en flytande lösning eller i fast fas. I allmänhet framställs peptider kortare än 8 aminosyror mer ekonomiskt genom lösningskemi. Peptider som är större än 8 rester sätts i allmänhet samman med fastfaskemi. Fastfaspeptidsyntes (SPPS) kan utföras antingen manuellt eller på ett helt automatiserat sätt. Manuell syntes av korta peptider är fördelaktigt eftersom det möjliggör mer flexibilitet vid uppskalning och det tillåter felsökning av oväntade problem med enklare. Till exempel kan en operatör tvätta bort piperidin under Fmoc-avskyddning, i händelse av strömavbrott eller instrumentfel. Dessutom kan termodynamisk blandning kontrolleras bättre med ett manuellt tillvägagångssätt. Å andra sidan har storskaliga helautomatiska peptidsyntesinstrument den uppenbara fördelen av obevakad drift och omfattande dokumentation av synteskörningen. Därför väljs automatiserad peptidsyntes vanligtvis som det bästa valet för syntes av längre peptider i mellanskaleområdet.
Kommersiell peptidsyntes
Tillhandahållare av peptidsyntes mäts genom kvalitetsnivån och den maximala längden av de syntetiserade peptiderna eftersom det är svårare att syntetisera längre peptider med hög kvalitet. De syntetiserade peptiderna måste genomgå en QC-procedur genom analytisk HPLC och masspektrometri. Ofta krävs också aminosyraanalys och sekvensering.
Tillämpningar av kommersiellt syntetiserade peptider
Biologiskt aktiva peptider har integrerats i ett växande antal aktiva farmaceutiska ingredienser (API) såväl som fristående produkter som vasopressin , gonadorelin , leuprolid och goserelin . Slutförandet av det mänskliga genomprojektet resulterade i identifieringen av cirka 30 000 proteiner kodade i det mänskliga genomet och gav många fler nya målmolekyler för biomedicinska forskare att utforska. För att undersöka möjligheten att öka den naturliga styrkan hos en given peptid eller protein med hjälp av en rationell designmetod, behövs små och stora mängder peptider, några i milligramskalan. När väl en önskad aktivitet eller styrka har identifierats behövs större syntes. För detta kan gram till multigramskala behövas för att initiera små djurstudier. Ofta, efter framgångsrik validering, kan en ännu större syntesskala vara önskvärd. Dessa kan variera i skala från hundratals gram till flera kilo.
