Alex K. Shalek

Alex Shalek
Alex K. Shalek, PhD.jpg
Alex Shalek, augusti 2019
Född ( 1981-12-18 ) 18 december 1981
Utmärkelser




Harold E. Edgerton Faculty Achievement Award, MIT (2020) Pew Charitable Trust Pew-Stewart Scholar (2018) Alfred P. Sloan Foundation Sloan Research Fellow (2018) Searle Scholars Program (2015) Beckman Young Investigators Award (2015) NIH Director's New Innovator Award (2015)
Vetenskaplig karriär
institutioner




Massachusetts Institute of Technology Broad Institute Koch Institute for Integrative Cancer Research Ragon Institute Mass General Hospital Harvard Medical School
Doktorand rådgivare Hongkun Park
Hemsida www .shaleklab .com

Alex K. Shalek är en biomedicinsk ingenjör och en kärnfakultetsmedlem i Institutet för medicinsk teknik och vetenskap (IMES), en docent i kemi och en extramural medlem av Koch Institute for Integrative Cancer Research vid Massachusetts Institute of Technology . Dessutom är han medlem av Ragon Institute och institutmedlem i Broad Institute , assistent i immunologi vid Massachusetts General Hospital och instruktör i hälsovetenskap och teknologi vid Harvard Medical School . Den multidisciplinära forskningen från Shalek Lab syftar till att skapa och implementera brett tillämpliga metoder för att studera och konstruera cellulära svar i vävnader, för att driva biologiska upptäckter och förbättra prognostik, diagnostik och terapi för autoimmuna, infektions- och cancersjukdomar. Shalek och hans labb är mest kända för sitt arbete med encellig genomik och för att studera ett antal förödande, men svårstuderade, mänskliga sjukdomar med partners runt om i världen.

Utbildning och tidigare forskning

Shalek fick sin BA summa cum laude 2004 från Columbia University där han studerade kemisk fysik som John Jay Scholar med Richard Bersohn och Louis Brus . Han utförde sedan examensarbete i kemisk fysik och utvecklade arrayer av nanotrådar som cellulära "sprutor" och elektrokemiska sonder under ledning av Hongkun Park vid Harvard University. Efter att, som postdoktor, under ledning av Park och Aviv Regev vid Broad Institute, hjälpte Shalek att banbryta encellsmönster i cellulära svar för att studera hur celler reagerar olika på samma tillstånd, vilket visar att genomgående genuttryck samvariation över celler skulle kunna användas för att definiera cellulära typer och tillstånd, deras interna "kretsar", från "bottom-up".

Som en oberoende utredare har Shalek och hans labb hjälpt till att skala och förenkla enkelcellsgenomik för att studera komplexa kliniska prov med låg ingång runt om i världen. Parallellt har de använt dessa och andra tillvägagångssätt [ överdrivna citeringar ] för att undersöka orsakerna och konsekvenserna av cellulär heterogenitet över cancer, infektionssjukdomar, [ överdrivna citat ] och inflammation.

Pågående forskning

Nuvarande arbete i Shalek Lab inkluderar både utvecklingen av brett möjliggörande teknologier såväl som deras tillämpning för att karakterisera, modellera och kontrollera flercelliga system. När det gäller teknikutveckling, samlar labbet forskningsområden inom genomik , kemisk biologi och nanoteknik för att etablera tillgängliga metoder för att profilera och kontrollera celler och deras interaktioner.

Utöver dessa verktyg med det globala forskarsamhället, använder labbet dem för att dissekera mänskliga sjukdomar, som COVID-19, och metodiskt kopplar cellulära funktioner och kliniska observationer. Viktiga fokusområden inkluderar hur: immunceller koordinerar balanserade svar på miljöpåfrestningar; värdcell-patogen-interaktioner utvecklas under infektion; [ överdrivna citat ] och tumörceller undviker terapeutisk behandling och naturlig immunitet.

Utifrån dessa och andras observationer syftar labbet till att förstå hur sjukdom förändrar vävnadsfunktion på cellnivå och förverkliga terapeutiska och profylaktiska ingrepp för att återupprätta eller stödja människors hälsa.

Välj utmärkelser och utmärkelser

2019-20 Harold E. Edgerton Faculty Achievement Award 2020

Young Mentor Award, Harvard Medical School , 2020

Pew-Stewart Scholar, Pew Charitable Trust Charitable Trust, 2018 – 2022

Sloan Research Fellow in Chemistry, Alfred P. Sloan Foundation , 2018 – 2020

Pfizer-Laubachs karriärutvecklingsprofessur, MIT, 2017 – 2020

Biträdande vetenskaplig rådgivare, Science Translational Medicine, 2016

NIH Director's New Innovator Award , 2015 – 2020

Beckman Young Investigators Award Arnold och Mabel Beckman Foundation, 2015 – 2019

Searle Scholars Program , Kinship Foundation, 2015 – 2018

"Follow That Cell"-tävlingen första plats (lagmedlem), NIH, 2015

Hermann LF von Helmholtz Karriärutvecklingsprofessur, MIT, 2014 – 2016

Excellence Award, Broad Institute of Harvard och MIT, 2013

Dudley R. Herschbach Teaching Award, Harvard University, 2006

Graduate Research Fellowship, NSF, 2005 – 2008

Certificate of Distinction in Teaching, Harvard University, 2005

Phi Beta Kappa, Columbia University, 2004

John Jay Scholar, Columbia University, 2000 – 2004

Välj publikationer

  • Huang, Siyi et al. (2021-01-21). "Lymfkörtlar innerveras av en unik population av sensoriska neuroner med immunmodulerande potential". Cell . 184 (2): 441–459.e25
  • Ziegler, CGK et al. (2020-05-28). "SARS-CoV-2-receptorn ACE2 är en interferonstimulerad gen i humana luftvägsepitelceller och detekteras i specifika cellundergrupper över vävnader," Cell, 181, 1016 (2020).
  • Hughes, Travis K. et al. (2020-10-13). "Second-Stand Synthesis-Based Massively Parallel ScRNA-Seq avslöjar cellulära tillstånd och molekylära egenskaper hos mänskliga inflammatoriska hudpatologier". Immunitet . 53 (4): 878–894.e7.
  • Kotliar, Dylan et al. (2020-11-25). "Encellsprofilering av ebolavirussjukdom in vivo avslöjar viral och värddynamik". Cell . 183 (5): 1383–1401.e19.
  • Kazer, Samuel W. et al. (2020-04). "Integrerad encellsanalys av multicellulär immundynamik under hyperakut HIV-1-infektion". Naturmedicin . 26 (4): 511–518.
  • Smillie, C.# et al. (2019). "Intra- och intercellulär omkoppling av den mänskliga tjocktarmen under ulcerös kolit" Cell , 178 , 714 (2019).
  • Ordovas-Montanes, J. et al. (2018). "Minskad cellulär mångfald och ett förändrat basalt progenitorcellstillstånd informerar om epitelbarriärdysfunktion i mänsklig typ 2-immunitet," Nature , 560 , 649 (2018).
  • Martin-Gayo, E. et al. (2018). "Ett rationellt ramverk för att modulera ensembles immunbeteende inspirerat av HIV-1 Elite Control", Genome Biol. , 19 , 10 (2018).
  • TM Gierahn et al. (2017) "Seq-Well: En bärbar, lågkostnadsplattform för encells-RNA-Seq av lågingångsprov." Natur Meth . 14 (2017): 395.
  • I. Tirosh et al. (2017) "Dissektion av det multicellulära ekosystemet av metastaserande melanom genom encellig RNA-seq." Science 352.6282 (2016): 189-96.
  • EZ Macosko et al. (2015). "Genomomfattande uttrycksprofilering av tusentals individuella celler med nanoliterdroppar." Cell 161 (2015): 1202-14.
  • AK Shalek et al. (2014). "Storskalig encellig RNA-Seq avslöjar strategier för att reglera cell-till-cell dynamisk variation genom parakrin signalering." Nature 510 (2014): 363.
  • AK Shalek et al. (2013). "Encellig transkriptomik avslöjar bimodalitet i uttryck och splitsning i immunceller." Nature 498 (2013): 236-40.
  • N. Yosef et al. (2013). "Dynamiskt reglerande nätverk som kontrollerar Th17-celldifferentiering." Nature 496 (2013): 461-68.
  1. ^ "Shalek Lab" . shaleklab.com . Hämtad 2020-10-30 .
  2. ^     Robinson, Jacob T.; Jorgolli, Marsela; Shalek, Alex K.; Yoon, Myung-Han; Gertner, Rona S.; Park, Hongkun (mars 2012). "Vertikala nanotrådselektroduppsättningar som en skalbar plattform för intracellulär gränssnitt till neuronala kretsar" . Naturen nanoteknik . 7 (3): 180–184. Bibcode : 2012NatNa...7..180R . doi : 10.1038/nnano.2011.249 . ISSN 1748-3395 . PMC 4209482 . PMID 22231664 .
  3. ^ a b     Shalek, Alex K.; Satija, Rahul; Adiconis, Xian; Gertner, Rona S.; Gaublomme, Jellert T.; Raychowdhury, Raktima; Schwartz, Schraga; Josef, Nir; Malboeuf, Christine; Lu, Diana; Trombetta, John J. (juni 2013). "Encellig transkriptomik avslöjar bimodalitet i uttryck och splitsning i immunceller" . Naturen . 498 (7453): 236–240. Bibcode : 2013Natur.498..236S . doi : 10.1038/nature12172 . ISSN 1476-4687 . PMC 3683364 . PMID 23685454 .
  4. ^ a b     Shalek, Alex K.; Satija, Rahul; Shuga, Joe; Trombetta, John J.; Gennert, Dave; Lu, Diana; Chen, Peilin; Gertner, Rona S.; Gaublomme, Jellert T.; Josef, Nir; Schwartz, Schraga (juni 2014). "Encellig RNA-seq avslöjar dynamisk parakrin kontroll av cellulär variation" . Naturen . 510 (7505): 363–369. Bibcode : 2014Natur.510..363S . doi : 10.1038/nature13437 . ISSN 1476-4687 . PMC 4193940 . PMID 24919153 .
  5. ^ a b c d     Gierahn, Todd M.; Wadsworth, Marc H.; Hughes, Travis K.; Bryson, Bryan D.; Butler, Andrew; Satija, Rahul; Fortune, Sarah; Kärlek, J. Christopher; Shalek, Alex K. (april 2017). "Seq-Well: bärbar, billig RNA-sekvensering av enstaka celler med hög genomströmning" . Naturmetoder . 14 (4): 395–398. doi : 10.1038/nmeth.4179 . hdl : 1721.1/113430 . ISSN 1548-7105 . PMC 5376227 . PMID 28192419 .
  6. ^ "Göra encellig RNA-sekvensering allmänt tillgänglig" . MIT Nyheter | Massachusetts Institute of Technology . Hämtad 2021-02-17 .
  7. ^ a b     Macosko, Evan Z.; Basu, Anindita; Satija, Rahul; Nemesh, James; Shekhar, Karthik; Goldman, Melissa; Tirosh, Itay; Bialas, Allison R.; Kamitaki, Nolan; Martersteck, Emily M.; Trombetta, John J. (2015-05-21). "Mycket parallell genomomfattande uttrycksprofilering av enskilda celler med användning av nanoliter droppar" . Cell . 161 (5): 1202–1214. doi : 10.1016/j.cell.2015.05.002 . ISSN 0092-8674 . PMC 4481139 . PMID 26000488 .
  8. ^ a b c d e f     Hughes, Travis K.; Wadsworth, Marc H.; Gierahn, Todd M.; Gör, Tran; Weiss, David; Andrade, Priscila R.; Ma, Feiyang; Silva, Bruno J. de Andrade; Shao, Shuai; Tsoi, Lam C.; Ordovas-Montanes, Jose (2020-10-13). "Second-Stand Synthesis-Based Massively Parallel ScRNA-Seq avslöjar cellulära tillstånd och molekylära egenskaper hos mänskliga inflammatoriska hudpatologier" . Immunitet . 53 (4): 878–894.e7. doi : 10.1016/j.immuni.2020.09.015 . ISSN 1074-7613 . PMC 7562821 . PMID 33053333 .
  9. ^ a b c d     Kazer, Samuel W.; Aicher, Toby P.; Muema, Daniel M.; Carroll, Shaina L.; Ordovas-Montanes, Jose; Miao, Vincent N.; Tu, Ang A.; Ziegler, Carly GK; Nyquist, Sarah K.; Wong, Emily B.; Ismail, Nasreen (april 2020). "Integrerad encellsanalys av multicellulär immundynamik under hyperakut HIV-1-infektion" . Naturmedicin . 26 (4): 511–518. doi : 10.1038/s41591-020-0799-2 . ISSN 1546-170X . PMC 7237067 . PMID 32251406 .
  10. ^ a b c d     Kotliar, Dylan; Lin, Aaron E.; Logue, James; Hughes, Travis K.; Khoury, Nadine M.; Raju, Siddharth S.; Wadsworth, Marc H.; Chen, Han; Kurtz, Jonathan R.; Dighero-Kemp, Bonnie; Björnson, Zach B. (2020-11-25). "Encellsprofilering av ebolavirussjukdom in vivo avslöjar viral- och värddynamik" . Cell . 183 (5): 1383–1401.e19. doi : 10.1016/j.cell.2020.10.002 . ISSN 0092-8674 . PMC 7707107 . PMID 33159858 .
  11. ^     Genshaft, Alex S.; Li, Shuqiang; Gallant, Caroline J.; Darmanis, Spyros; Prakadan, Sanjay M.; Ziegler, Carly GK; Lundberg, Martin; Fredriksson, Simon; Hong, Joyce; Regev, Aviv; Livak, Kenneth J. (2016-09-19). "Multiplexad, riktad profilering av encelliga proteomer och transkriptomer i en enda reaktion" . Genombiologi . 17 (1): 188. doi : 10.1186/s13059-016-1045-6 . ISSN 1474-760X . PMC 5027636 . PMID 27640647 .
  12. ^     Kimmerling, Robert J.; Lee Szeto, Gregory; Li, Jennifer W.; Genshaft, Alex S.; Kazer, Samuel W.; Payer, Kristofor R.; de Riba Borrajo, Jacob; Blainey, Paul C.; Irvine, Darrell J.; Shalek, Alex K.; Manalis, Scott R. (2016-01-06). "En mikrofluidisk plattform som möjliggör encellig RNA-sekvens av multigenerationella linjer" . Naturkommunikation . 7 (1): 10220. Bibcode : 2016NatCo...710220K . doi : 10.1038/ncomms10220 . ISSN 2041-1723 . PMC 4729820 . PMID 26732280 .
  13. ^     Tu, Ang A.; Gierahn, Todd M.; Monian, Brinda; Morgan, Duncan M.; Mehta, Naveen K.; Ruiter, Bert; Shreffler, Wayne G.; Shalek, Alex K.; Love, J. Christopher (december 2019). "TCR-sekvensering parad med massivt parallella 3′ RNA-sekvenser avslöjar klonotypiska T-cellsignaturer" . Nature Immunology . 20 (12): 1692–1699. doi : 10.1038/s41590-019-0544-5 . ISSN 1529-2916 . PMC 7528220 . PMID 31745340 .
  14. ^     Galen, Peter van; Hovestadt, Volker; Ii, Marc H. Wadsworth; Hughes, Travis K.; Griffin, Gabriel K.; Battaglia, Sofia; Verga, Julia A.; Stephansky, Jason; Pastika, Timothy J.; Story, Jennifer Lombardi; Pinkus, Geraldine S. (2019-03-07). "Encellig RNA-Seq avslöjar AML-hierarkier som är relevanta för sjukdomsprogression och immunitet" . Cell . 176 (6): 1265–1281.e24. doi : 10.1016/j.cell.2019.01.031 . ISSN 0092-8674 . PMC 6515904 . PMID 30827681 .
  15. ^ a b c     Tirosh, Itay; Izar, Benjamin; Prakadan, Sanjay M.; Wadsworth, Marc H.; Treacy, Daniel; Trombetta, John J.; Rotem, Asaf; Rodman, Christopher; Lian, Christine; Murphy, George; Fallahi-Sichani, Mohammad (2016-04-08). "Dissektion av det multicellulära ekosystemet av metastaserande melanom genom encellig RNA-seq" . Vetenskap . 352 (6282): 189–196. Bibcode : 2016Sci...352..189T . doi : 10.1126/science.aad0501 . ISSN 0036-8075 . PMC 4944528 . PMID 27124452 .
  16. ^     Lohr, Jens G.; Adalsteinsson, Viktor A.; Cibulskis, Kristian; Choudhury, Atish D.; Rosenberg, Mara; Cruz-Gordillo, Peter; Francis, Joshua M.; Zhang, Cheng-Zhong; Shalek, Alex K.; Satija, Rahul; Trombetta, John J. (maj 2014). "Hel-exom-sekvensering av cirkulerande tumörceller ger ett fönster till metastaserad prostatacancer" . Natur Bioteknik . 32 (5): 479–484. doi : 10.1038/nbt.2892 . ISSN 1546-1696 . PMC 4034575 . PMID 24752078 .
  17. ^ a b     Patel, Anoop P.; Tirosh, Itay; Trombetta, John J.; Shalek, Alex K.; Gillespie, Shawn M.; Wakimoto, Hiroaki; Cahill, Daniel P.; Nahed, Brian V.; Curry, William T.; Martuza, Robert L.; Louis, David N. (2014-06-20). "Encellig RNA-seq belyser intratumoral heterogenitet i primärt glioblastom" . Vetenskap . 344 (6190): 1396–1401. Bibcode : 2014Sci...344.1396P . doi : 10.1126/science.1254257 . ISSN 0036-8075 . PMC 4123637 . PMID 24925914 .
  18. ^ a b     Hamza, Bashar; Ng, Sheng Rong; Prakadan, Sanjay M.; Delgado, Francisco Feijó; Chin, Christopher R.; King, Emily M.; Yang, Lucy F.; Davidson, Shawn M.; DeGouveia, Kelsey L.; Cermak, Nathan; Navia, Andrew W. (2019-02-05). "Optofluidisk realtidscellsorterare för longitudinella CTC-studier i musmodeller av cancer" . Proceedings of the National Academy of Sciences . 116 (6): 2232–2236. Bibcode : 2019PNAS..116.2232H . doi : 10.1073/pnas.1814102116 . ISSN 0027-8424 . PMC 6369805 . PMID 30674677 .
  19. ^ a b     Kimmerling, Robert J.; Prakadan, Sanjay M.; Gupta, Alejandro J.; Calistri, Nicholas L.; Stevens, Mark M.; Olcum, Selim; Cermak, Nathan; Drake, Riley S.; Pelton, Kristine; De Smet, Frederik; Ligon, Keith L. (2018-11-27). "Länka encellsmätningar av massa, tillväxthastighet och genuttryck" . Genombiologi . 19 (1): 207. doi : 10.1186/s13059-018-1576-0 . ISSN 1474-760X . PMC 6260722 . PMID 30482222 .
  20. ^ a b     Ziegler, Carly GK; Allon, Samuel J.; Nyquist, Sarah K.; Mbano, Ian M.; Miao, Vincent N.; Tzouanas, Constantine N.; Cao, Yuming; Yousif, Ashraf S.; Bals, Julia; Hauser, Blake M.; Feldman, Jared (2020-05-28). "SARS-CoV-2-receptorn ACE2 är en interferonstimulerad gen i epitelceller från mänskliga luftvägar och detekteras i specifika cellundergrupper över vävnader" . Cell . 181 (5): 1016–1035.e19. doi : 10.1016/j.cell.2020.04.035 . ISSN 0092-8674 . PMC 7252096 . PMID 32413319 .
  21. ^ a b   Gideon, Hannah P.; Hughes, Travis K.; Wadsworth, Marc H.; Tu, Ang Andy; Gierahn, Todd M.; Hopkins, Forrest F.; Wei, Jun-Rong; Kummerlowe, Conner; Grant, Nicole L.; Nargan, Kievershen; Phuah, JiaYao (2020-10-26). "Encellsprofilering av tuberkuloslunggranulom avslöjar funktionella lymfocytsignaturer för bakteriekontroll" . bioRxiv : 2020.10.24.352492. doi : 10.1101/2020.10.24.352492 . S2CID 226229228 .
  22. ^ a b     Waldman, Benjamin S.; Schwarz, Dominic; Wadsworth, Marc H.; Saeij, Jeroen P.; Shalek, Alex K.; Lourido, Sebastian (2020-01-23). "Identifiering av en Master Regulator of Differentiation in Toxoplasma" . Cell . 180 (2): 359–372.e16. doi : 10.1016/j.cell.2019.12.013 . ISSN 0092-8674 . PMC 6978799 . PMID 31955846 .
  23. ^ a b     Darrah, Patricia A.; Zeppa, Joseph J.; Maiello, Pauline; Hackney, Joshua A.; Wadsworth, Marc H.; Hughes, Travis K.; Pokkali, Supriya; Swanson, Philip A.; Grant, Nicole L.; Rodgers, Mark A.; Kamath, Megaha (januari 2020). "Förebyggande av tuberkulos hos makaker efter intravenös BCG-immunisering" . Naturen . 577 (7788): 95–102. Bibcode : 2020Natur.577...95D . doi : 10.1038/s41586-019-1817-8 . ISSN 1476-4687 . PMC 7015856 . PMID 31894150 .
  24. ^     Ranasinghe, Srinika; Lamothe, Pedro A.; Soghoian, Damien Z.; Kazer, Samuel W.; Cole, Michael B.; Shalek, Alex K.; Josef, Nir; Jones, R. Brad; Donaghey, Faith; Nwonu, Chioma; Jani, Priya (2016-10-18). "Antivirala CD8+ T-celler begränsade av humant leukocytantigen klass II existerar under naturlig HIV-infektion och uppvisar klonal expansion" . Immunitet . 45 (4): 917–930. doi : 10.1016/j.immuni.2016.09.015 . ISSN 1074-7613 . PMC 5077698 . PMID 27760342 .
  25. ^ a b   Raghavan, Srivatsan; Winter, Peter S.; Navia, Andrew W.; Williams, Hannah L.; DenAdel, Alan; Kalekar, Radha L.; Galvez-Reyes, Jennyfer; Lowder, Kristen E.; Mulugeta, Nolawit; Raghavan, Manisha S.; Borah, Ashir A. (2020-08-25). "Transkriptionell subtyp-specifik mikromiljööverhörning och tumörcellplasticitet i metastaserad pankreascancer" . bioRxiv : 2020.08.25.256214. doi : 10.1101/2020.08.25.256214 . S2CID 221355597 .
  26. ^ a b c     Martin-Gayo, Enrique; Cole, Michael B.; Kolb, Kelly E.; Ouyang, Zhengyu; Cronin, Jacqueline; Kazer, Samuel W.; Ordovas-Montanes, Jose; Lichterfeld, Mathias; Walker, Bruce D.; Josef, Nir; Shalek, Alex K. (2018-01-29). "Ett reproducerbarhetsbaserat beräkningsramverk identifierar ett inducerbart, förbättrat antiviralt tillstånd i dendritiska celler från HIV-1 Elite Controllers" . Genombiologi . 19 (1): 10. doi : 10.1186/s13059-017-1385-x . ISSN 1474-760X . PMC 5789701 . PMID 29378643 .
  27. ^     Kløverpris, Henrik N.; Kazer, Samuel W.; Mjösberg, Jenny; Mabuka, Jennifer M.; Wellmann, Amanda; Ndhlovu, Zaza; Yadon, Marisa C.; Nhamoyebonde, Herde; Muenchhoff, Maximilian; Simoni, Yannick; Andersson, Frank (2016-02-16). "Medfödda lymfoida celler utarmas irreversibelt under akut HIV-1-infektion i frånvaro av viral suppression" . Immunitet . 44 (2): 391–405. doi : 10.1016/j.immuni.2016.01.006 . ISSN 1074-7613 . PMC 6836297 . PMID 26850658 .
  28. ^ a b c     Ordovas-Montanes, Jose; Dwyer, Daniel F.; Nyquist, Sarah K.; Buchheit, Kathleen M.; Vukovic, Marko; Deb, Chaarushena; Wadsworth, Marc H.; Hughes, Travis K.; Kazer, Samuel W.; Yoshimoto, Eri; Cahill, Katherine N. (augusti 2018). "Allergiskt inflammatoriskt minne i mänskliga respiratoriska epitelceller" . Naturen . 560 (7720): 649–654. Bibcode : 2018Natur.560..649O . doi : 10.1038/s41586-018-0449-8 . hdl : 1721.1/122932 . ISSN 1476-4687 . PMC 6133715 . PMID 30135581 .
  29. ^ a b c     Smillie, Christopher S.; Biton, Moshe; Ordovas-Montanes, Jose; Sullivan, Keri M.; Burgin, Grace; Graham, Daniel B.; Herbst, Rebecca H.; Rogel, Noga; Slyper, Michal; Waldman, Julia; Sud, Malika (2019-07-25). "Intra- och intercellulär omkoppling av den mänskliga tjocktarmen under ulcerös kolit" . Cell . 178 (3): 714–730.e22. doi : 10.1016/j.cell.2019.06.029 . ISSN 0092-8674 . PMC 6662628 . PMID 31348891 .
  30. ^ "Teknik identifierar T-celler förberedda för vissa allergier eller infektioner: Forskare utvecklar en metod för att isolera och sekvensera RNA från T-celler som reagerar på ett specifikt mål" . ScienceDaily . Hämtad 2021-02-17 .
  31. ^    Majumder, Partha P.; Mhlanga, Musa M.; Shalek, Alex K. (oktober 2020). "The Human Cell Atlas och rättvisa: lärdomar" . Naturmedicin . 26 (10): 1509–1511. arXiv : 2010.16154 . doi : 10.1038/s41591-020-1100-4 . ISSN 1546-170X . PMID 33029017 .
  32. ^ "Forskare identifierar celler som troligen är inriktade på Covid-19-virus" . MIT Nyheter | Massachusetts Institute of Technology . Hämtad 2021-02-17 .
  33. ^ "In i lungorna och bortom" . hms.harvard.edu . Hämtad 2021-02-17 .
  34. ^ a b     Huang, Siyi; Ziegler, Carly GK; Austin, John; Mannoun, Najat; Vukovic, Marko; Ordovas-Montanes, Jose; Shalek, Alex K.; Andrian, Ulrich H. von (2021-01-21). "Lymfkörtlar innerveras av en unik population av sensoriska neuroner med immunmodulerande potential" . Cell . 184 (2): 441–459.e25. doi : 10.1016/j.cell.2020.11.028 . ISSN 0092-8674 . PMC 9612289 . PMID 33333021 .
  35. ^     Nirschl, Christopher J.; Suárez-Fariñas, Mayte; Izar, Benjamin; Prakadan, Sanjay; Dannenfelser, Ruth; Tirosh, Itay; Liu, Yong; Zhu, Qian; Devi, K. Sanjana P.; Carroll, Shaina L.; Chau, David (2017-06-29). "IFNγ-beroende vävnadsimmun homeostas är samordnad i tumörmikromiljön" . Cell . 170 (1): 127–141.e15. doi : 10.1016/j.cell.2017.06.016 . ISSN 0092-8674 . PMC 5569303 . PMID 28666115 .
  36. ^ "Alex Shalek vinner Edgerton Faculty Award" . MIT Nyheter | Massachusetts Institute of Technology . Hämtad 2020-12-11 .
  37. ^ "Excellens i utmärkelser för mentorskap" . Office for Diversity Inclusion and Community Partnership vid Harvard Medical School . Hämtad 2020-12-11 .
  38. ^ "Shalek utnämnde 2018 Pew-Stewart Scholar for Cancer Research - MIT Department of Chemistry" . Hämtad 2020-12-11 .
  39. ^ "IMES Professor Alex Shalek vinner 2018 års Sloan Research Fellowship" . Institutet för medicinsk teknik och vetenskap . 2018-02-15 . Hämtad 2021-02-09 .
  40. ^ "Alex Shalek namngav Pfizer-Laubach karriärutvecklingsprofessor – Shalek Lab" . shaleklab.com . Hämtad 2020-12-11 .
  41. ^ "Föregående ASAs | Vetenskap translationell medicin" . stm.sciencemag.org . Hämtad 2021-02-17 .
  42. ^ "Shalek tilldelas NIH New Innovator Award" . Ragon Institute of MGH, MIT och Harvard . 2015-10-06 . Hämtad 2020-12-11 .
  43. ^ "Alex Shalek" . Arnold och Mabel Beckmans stiftelse . Hämtad 2020-12-11 .
  44. ^ "Alex Shalek" . Searle Scholars Program . Hämtad 2020-12-11 .
  45. ^ a b c d e f g h "Alex K. Shalek" . Institutet för medicinsk teknik och vetenskap . Hämtad 2021-02-09 .
  46. ^     Josef, Nir; Shalek, Alex K.; Gaublomme, Jellert T.; Jin, Hulin; Lee, Youjin; Awasthi, Amit; Wu, Chuan; Karwacz, Katarzyna; Xiao, Sheng; Jorgolli, Marsela; Gennert, David (april 2013). "Dynamiskt regulatoriskt nätverk som styr TH 17-celldifferentiering" . Naturen . 496 (7446): 461–468. Bibcode : 2013Natur.496..461Y . doi : 10.1038/nature11981 . ISSN 1476-4687 . PMC 3637864 . PMID 23467089 .

externa länkar