ATP-syntassubenhet C
ATPas av V-typ från Enterococcus hirae . Beräknade kolvätegränser för lipiddubbelskiktet visas med röda och blå prickar
| |||||||||
| Identifierare | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Symbol | ATP-synt_C | ||||||||
| Pfam | PF00137 | ||||||||
| InterPro | IPR002379 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00526 | ||||||||
| SCOP2 | 1aty / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| OPM superfamilj | 5 | ||||||||
| OPM-protein | 2bl2 | ||||||||
| |||||||||
ATPas, subenhet C av Fo/Vo-komplex är den huvudsakliga transmembrana subenheten av ATP-syntaser av V-typ, A-typ och F-typ . Subenhet C (även kallad subenhet 9, eller proteolipid i F-ATPaser, eller 16 kDa proteolipiden i V-ATPaser) hittades i Fo- eller Vo-komplexet av F- respektive V-ATPaser. Subenheterna bildar en oligomer c-ring som utgör Fo/Vo/Ao-rotorn, där det faktiska antalet subenheter varierar mycket mellan specifika enzymer.
ATPaser (eller ATP-syntaser) är membranbundna enzymkomplex/jontransportörer som kombinerar ATP-syntes och/eller hydrolys med transport av protoner över ett membran. ATPaser kan utnyttja energin från en protongradient genom att använda jonflödet över membranet via ATPase-protonkanalen för att driva syntesen av ATP. Vissa ATPaser fungerar omvänt och använder energin från hydrolysen av ATP för att skapa en protongradient. Det finns olika typer av ATPaser, som kan skilja sig åt i funktion (ATP-syntes och/eller hydrolys), struktur (F-, V- och A-ATPaser innehåller roterande motorer) och i vilken typ av joner de transporterar.
F-ATPaserna (eller F1Fo ATPaserna) och V-ATPaserna (eller V1Vo ATPaserna) är var och en sammansatt av två sammanlänkade komplex: F1- eller V1-komplexet innehåller den katalytiska kärnan som syntetiserar/hydrolyserar ATP, och Fo- eller Vo-komplexet som bildar membranomspännande por. F- och V-ATPaserna innehåller alla roterande motorer, en som driver protontranslokation över membranet och en som driver ATP-syntes/hydrolys.
I F-ATPaser driver flödet av protoner genom ATPase-kanalen rotationen av C-subenhetsringen, som i sin tur är kopplad till rotationen av F1-komplex gamma-subenhetsrotorn på grund av den permanenta bindningen mellan gamma- och epsilon-subenheterna i F1 och C-subenhetsringen av Fo. Den sekventiella protoneringen och deprotoneringen av Asp61 av subenhet C är kopplad till den stegvisa rörelsen av rotorn.
I V-ATPaser finns det tre proteolipidsubenheter (c, c′ och c′′) som utgör en del av den protonledande poren, var och en innehåller en nedgrävd glutaminsyrarest som är väsentlig för protontransport.
I en nyligen genomförd studie har c-subenhet indikerats som en kritisk komponent i den mitokondriella permeabilitetsövergångsporen.
Underfamiljer
- ATPas, Vo-komplex, proteolipidsubenhet C, InterPro : IPR000245
- ATPas, Fo-komplex, subenhet C InterPro : IPR000454
Humana proteiner som innehåller denna domän
ATP5G1 ; ATP5G2 ; ATP5G3 ; ATP6V0B ; ATP6V0C ;