A2 holin familj

Den förmodade Archaeal 2 TMS Holin (A2-Hol)-familjen ( TC# 9.B.109) består av ett fåtal förmodade holiner från Nitrososphaerota som sträcker sig i storlek från cirka 130 till 165 aminoacylrester (aas) och uppvisar 2 transmembransegment (TMS). ). En representativ lista över proteiner som tillhör A2-Hol-familjen finns i Transporter Classification Database . Arkeonen , Candidatus Nitrosoarchaeum limnia , kodar för intilliggande gener betecknade Toxin Secretion / Lysis Holin. "Toxin"-genen kodar för ett lösligt protein på 325 aas som anges som tillhörande "Glycosyltransferase GBT-type Superfamily". Detta protein tar upp andra glykosyltransferaser i en NCBI BLAST-sökning. Den intilliggande genen kodar för ett litet protein på 132 aas och 2 TMS ( TC# 9.B.109.1.1 ) som kan vara ett holin, baserat på dess storlek och topologi. Detta protein har UniProt-accessionsnumret för S2E3C4 . Paraloger finns i samma organism (Candidatus Nitrosoarchaeum koreensis ) och andra närbesläktade arter.

Se även

• Holin
• Lysin
• Databas för klassificering av transportörer

Vidare läsning

•      Saier, Milton H.; Reddy, Bhaskara L. (2015-01-01). "Holins i bakterier, eukaryoter och arkéer: multifunktionella xenologer med potentiella bioteknologiska och biomedicinska tillämpningar" . Journal of Bacteriology 197 (1): 7–17. doi : 10.1128/JB.02046-14 . ISSN 0021-9193 . PMC 4288690 . PMID 25157079 .
•     Wang, IN; Smith, DL; Young, R. (2000-01-01). "Holins: proteinklockorna för bakteriofaginfektioner" . Annual Review of Microbiology 54 : 799–825. doi : 10.1146/annurev.micro.54.1.799 . ISSN 0066-4227 . PMID 11018145 .

Från och med denna redigering använder den här artikeln innehåll från "9.B.109. The Putative Archaeal 2 TMS Holin (A2-Hol) Family" , som är licensierad på ett sätt som tillåter återanvändning under Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , men inte under GFDL . Alla relevanta villkor måste följas.