5'-3' exoribonukleas 2

XRN2
Identifiers
	, entrez:22803, 5'-3' exoribonuclease 2
Externa IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS n/a
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

' Exoribonuclease 2 (XRN2) även känt som Dhm1-liknande protein är ett exoribonukleasenzym som hos människor kodas av XRN2 - genen .

Den mänskliga genen som kodar för XRN2 delar likhet med musens Dhm1 och jästens Dhp1 ( Schizosaccharomyces pombe ) eller RAT1 ( Saccharomyces ) gener. Jästgenen är involverad i homolog rekombination och RNA- metabolism , såsom RNA-syntes och RNA-handel och -terminering. Komplementeringsstudier visar att Dhm1 har en liknande funktion i mus som Dhp1.

Fungera

Human XRN2 är involverad i torpedmodellen för transkriptionsterminering.

C. elegans -homologen, XRN-2, är inblandad i nedbrytningen av vissa mogna miRNA och deras avlägsnande från miRISC miRNA.

I jäst har Rat1-proteinet visat sig också vara involverat i torpedtranskriptionstermineringsmodellen. När ett polyadenyleringsställe har detekterats på det begynnande RNA:t och klyvt av RNA-polymeras II , rekryterar Rtt103-faktorn Rat1 och fäster den till den fria änden. Exonukleasaktiviteten hos Rat1 bryter ned RNA-strängen och stoppar transkriptioner när de kommer ikapp polymeraset.

Se även

• Xrn1

externa länkar

• Mänskligt XRN2- genomplacering och XRN2- geninformationssida i UCSC Genome Browser .

Vidare läsning

•    Lehner B, Sanderson CM (2004). "En proteininteraktionsram för nedbrytning av humant mRNA" . Genome Res . 14 (7): 1315–23. doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC 442147 . PMID 15231747 .
•   Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J, et al. (2001). "DNA-sekvensen och jämförande analys av human kromosom 20" . Naturen . 414 (6866): 865–71. Bibcode : 2001Natur.414..865D . doi : 10.1038/414865a . PMID 11780052 .
•    Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, et al. (2006). "Ett sannolikhetsbaserat tillvägagångssätt för högkapacitetsproteinfosforyleringsanalys och platslokalisering". Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. doi : 10.1038/nbt1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .
•    Lu Y, Liu P, James M, et al. (2010). "Genetiska varianter cis-reglerande Xrn2 uttryck bidrar till risken för spontan lungtumör" . Onkogen . 29 (7): 1041–9. doi : 10.1038/onc.2009.396 . PMC 6019621 . PMID 19915612 .
•   Lejeune F, Li X, Maquat LE (2003). "Nonsens-medierat mRNA-sönderfall i däggdjursceller involverar decapping, deadenylering och exonukleolytiska aktiviteter" . Mol. Cell . 12 (3): 675–87. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00349-6 . PMID 14527413 .
•    Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). "Mot en katalog av mänskliga gener och proteiner: sekvensering och analys av 500 nya kompletta proteinkodande humana cDNAs" . Genome Res . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
•    Yang XC, Sullivan KD, Marzluff WF, Dominski Z (2009). "Studier av 5' exonukleas- och endonukleasaktiviteter för CPSF-73 i histon-pre-mRNA-bearbetning" . Mol. Cell. Biol . 29 (1): 31–42. doi : 10.1128/MCB.00776-08 . PMC 2612496 . PMID 18955505 .
•    Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). "Global, in vivo och platsspecifik fosforyleringsdynamik i signalnätverk" . Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
•    Scherl A, Couté Y, Déon C, et al. (2002). "Funktionell proteomisk analys av mänsklig nukleolus" . Mol. Biol. Cell . 13 (11): 4100–9. doi : 10.1091/mbc.E02-05-0271 . PMC 133617 . PMID 12429849 .
•    Kaneko S, Rozenblatt-Rosen O, Meyerson M, Manley JL (2007). "Det multifunktionella proteinet p54nrb/PSF rekryterar exonukleaset XRN2 för att underlätta pre-mRNA 3'-bearbetning och transkriptionsterminering" . Genes Dev . 21 (14): 1779–89. doi : 10.1101/gad.1565207 . PMC 1920172 . PMID 17639083 .
•    Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
•   Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 fullängds humana cDNAs" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
•    Gromak N, West S, Proudfoot NJ (2006). "Pausställen främjar transkriptionell terminering av däggdjurs-RNA-polymeras II" . Mol. Cell. Biol . 26 (10): 3986–96. doi : 10.1128/MCB.26.10.3986-3996.2006 . PMC 1488997 . PMID 16648491 .
•    Andersen JS, Lam YW, Leung AK, et al. (2005). "Nukleolär proteomdynamik". Naturen . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
•    Li J, Zheng H, Ji C, et al. (2005). "En ny splitsningsvariant av human XRN2-gen uttrycks huvudsakligen i blodleukocyter". DNA Sekv . 16 (2): 143–6. doi : 10.1080/10425170500066771 . PMID 16147866 . S2CID 35865401 .
•    Programteam för insamling av däggdjursgener; Strausberg, RL; Feingold, EA; Grouse, LH; et al. (2002). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds-cDNA-sekvenser för människor och mus" . Proceedings of the National Academy of Sciences . 99 (26): 16899–16903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•    Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). "Storskalig karakterisering av HeLa cell nukleära fosfoproteiner" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .

externa länkar

• XRN2+protein,+human vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)