De 16 vinnarna i den andra etappen gick vidare till åttondelsfinal.
Sådd
Från och med åttondelsfinalen seedades lagen enligt den andra etappens lottning, där varje lag tilldelades en "seed" 1–16 motsvarande den oavgjorda matchen de vann (O1–O16) (artikel 22.c i förordningarna).
I åttondelsfinalerna, kvartsfinalerna och semifinalerna spelades varje oavgjord match på hemma- och bortabasis, med det högreseedade laget som värd för den andra omgången (artikel 22.d i reglerna). Om det var oavgjort på sammanlagt användes regeln om bortamål . Om det fortfarande var oavgjort spelades ingen förlängning , och en straffläggning användes för att avgöra vinnaren (artikel 27 i reglerna).
Finalen spelades som en enda match på en plats som förhandsvalts av CONMEBOL, med det högre seedade laget utsett som "hemmalaget" för administrativa ändamål (artikel 25 i förordningen). Om oavgjort efter reglering spelades 30 minuters förlängning. Om det fortfarande var oavgjort efter förlängning användes en straffläggning för att avgöra vinnaren (artikel 28 i reglerna).
Konsol
Bracket med start från åttondelsfinalen bestämdes enligt följande:
Runda
Matchups
Omgång 16
(Högre seedade lag värd andra etappen)
Match A: Vinnare O1 vs. Vinnare O16
Match B: Vinnare O2 vs. Vinnare O15
Match C: Vinnare O3 vs. Vinnare O14
Match D: Vinnare O4 vs. Vinnare O13
Match E: Vinnare O5 vs. Vinnare O12
Match F: Vinnare O6 vs. Vinnare O11
Match G: Vinnare O7 vs. Vinnare O10
Match H: Vinnare O8 vs. Vinnare O9
Kvartsfinal
(Högre-seedade lag värd andra etappen)
Match S1: Vinnare A mot Vinnare H
Match S2: Vinnare B mot Vinnare G
Match S3: Vinnare C mot Vinnare F
Match S4: Vinnare D vs. Vinnare E
Semifinaler
(Högre-seedade lag värd andra etappen)
Match F1: Vinnare S1 mot Vinnare S4
Match F2: Vinnare S2 vs. Vinnare S3
Final
(Högre seedade lag utsetts till "hemma"-lag)
Vinnare F1 vs. Vinnare F2
Kopplingen avgjordes utifrån den andra etappens lottning, som hölls den 13 maj 2019.