Wildcats avslutade grundserien obesegrade (11–0) och var rankade tvåa i nationen inför deras match-up med tionde rangordnade Texas A&M i 1998 Big 12 Championship Game . Kansas State förlorade på övertid och förlorade sin chans till ett nationellt mästerskap.
Efter Big 12 Championship-spelet fick Kansas State ingen plats i den inledande Bowl Championship-serien trots att de var rankad bland sina topp fyra såväl som den högst rankade icke-mästaren från någon konferens. De var inte heller inbjudna till Cotton Bowl Classic i Dallas, som konferenstvåan vanligtvis skulle vara, eller Holiday Bowl i San Diego, som vid den tidpunkten kontrakterades för att bjuda in tredjeplatsen i konferensen; dessa skålar valde Texas och Nebraska istället. Istället bjöds Kansas State in till Alamo Bowl, där det förlorade mot de orankade Purdue Boilermakers , som körde 80 yards för en touchdown i sista minuten för att besegra Kansas State med 37–34.
Efter säsongens slut skapades en ny regel. Med smeknamnet "Kansas State Rule" skulle det #3 rankade laget alltid ha ett automatiskt bud på ett BCS bowl-spel.
Wildcats avslutade säsongen som det bästa laget i NCAA Division IA (med 48 poäng per match) och satte ett skolrekord för poäng med 610.
Kansas State välkomnade Texas för deras första Big 12 Conference-matchup, och första möte sedan 1942, och Texas första resa till Manhattan sedan 1926. 1998 Heisman Trophy-vinnaren Ricky Williams hölls till bara 43 yards på 25 bär för ett genomsnitt på bara 1,7 yards per transport. Han gjorde inte mål i matchen. Williams snittade 202 rusande yards per match 1998 och hölls till säsongens låga 43 yards, hans näst lägsta yardage var 90 yards mot Oklahoma State. K-State samlade 223 yards på marken på 51 sändningar och Wildcats vann handfast, 48–7.
Kansas State slog Colorado för andra året i rad (endast deras andra vinst mot Buffaloes sedan 1984) och vann sin första match i Boulder sedan 1973. K-State kom till Boulder med ett 2-24 rekord genom tiderna i matcher spelade i Boulder . K-State kom till Colorado och slog motståndet med i snitt 57 poäng per match och hade ett försvar som hade tillåtit totalt 21 poäng i sina första 4 matcher. Colorado var en 17-poängs underdog och hade bara förlorat en gång under de senaste 13 säsongerna mot Wildcats. Colorado höll K-State, som hade i genomsnitt 470 yards och 62 poäng som kom in i matchen, till 332 yards och bara 16 poäng. Colorado hade bara 225 yards totalt anfall, inklusive 37 yards som rusade på 31 försök.
Michael Bishop kastade för 306 yards och 2 touchdowns, och sprang för 140 yards och ytterligare två poäng när Wildcats slutligen slog igenom mot Huskers. Kansas State slog Nebraska för första gången sedan 1968 och första gången på Manhattan sedan 1959.
Kansas State besökte Columbia med sina nationella titelförhoppningar mycket levande och kunde gnissla fram en 31–25-seger. Andralagets All-American kicker Martin Gramatica missade okaraktäristiskt två field goals och puntreturneren David Allen återvände nästan sin sjunde karriärs puntretur för en touchdown. Rekord för skolkarriären Eric Hickson missade matchen med en hög vristvrickning och ersattes av David Allen och Frank Murphy på backfältet. Wildcats vann sin sjätte match i rad över Tigers (de skulle så småningom utöka serien till 13 matcher.
