Zoo blot
En zoo blot eller trädgårdsblot är en typ av Southern blöt som visar likheten mellan specifika, vanligtvis proteinkodande, DNA-sekvenser av olika arter. En zoo blot jämför djurarter medan en trädgård blot jämför växtarter. Syftet med zooblotten är att detektera bevarandet av den eller de intressanta generna under hela utvecklingen av olika arter.
För att förstå i vilken grad en viss gen är lik från art till art, isoleras DNA-extrakt från en uppsättning arter och sprids över en yta. Sedan märks en gensond specifik för en av arterna och får hybridisera till det preparerade DNA:t. Vanligtvis är sonden märkt med en radioaktiv isotop av fosfor . Efter hybridiseringen autoradiografi eller andra avbildningstekniker för att identifiera framgångsrikt hybridiserade prober, bevis på likhet mellan arternas genom.
Hybridiseringen mellan en sond och ett DNA-segment kommer att ske även när strängarna är lika men inte identiska. Som ett resultat används zoo blotting för att upptäcka liknande eller exakta släktskap mellan DNA i fråga och andra organismer. Det kan också hjälpa till att fastställa placeringen av introner och exoner, eftersom de senare kommer att vara mycket mer konserverade än de förra.
Se även