Yashar Niknafs

Yashar Niknafs
Alma mater	Case Western Reserve University University of Michigan
Yrke(n)	VD för LynxDx, Inc.
Vetenskaplig karriär
Fält	Cell- och molekylärbiologi, cancergenomik
institutioner	Michigans universitet
Doktorand rådgivare	Arul Chinnaiyan

Yashar Sharifi Niknafs är en amerikansk vetenskapsman, kodare och affärsman . Han fungerar för närvarande som verkställande direktör för Lynx Dx, Inc., en av de största leverantörerna av COVID-19 PCR -tester i delstaten Michigan .

tidigt liv och utbildning

Niknafs gick på Stow-Munroe Falls High School i Akron, Ohio , där han var involverad i teater och vetenskapsolympiad. Han avslutade sina grundstudier vid Case Western Reserve University och fick en kandidatexamen i biokemi innan han flyttade till Ann Arbor, Michigan , där han tog sin doktorsexamen från programmet för cell- och molekylärbiologi vid University of Michigan under mentorskap av Arul Chinnaiyan . Hans Ph.D. Arbetet fokuserade mest på bioinformatiska analyser av nästa generations sekvenseringsdata i syfte att bättre förstå genomet, avgränsa molekylära mekanismer som driver cancer och upptäcka nya genmål som biomarkörskandidater. Han stannade kvar på institutionen för att slutföra ett postdoktoralt stipendium i cancergenomik och bioinformatik.

Karriär

Chinnaiyan-laboratoriet hade tidigare identifierat TMPRSS2 - ERG (T2-ERG) genfusion som en ny biomarkör för prostatacancer . Istället för att fortsätta sin medicinska utbildning tog Niknafs en längre ledighet och grundade LynxDx tillsammans med Chinnaiyan och Jeffrey J Tosoian, en framstående urologisk onkolog, med avsikten att lansera MyProstateScore, ett pre-biopsitest med hjälp av T2-ERG, PCA3 och KLK3 biomarkörer för att upptäcka kliniskt signifikant prostatacancer. Han skrev också koden för företagets egenutvecklade laboratorieinformationshanteringssystem .

Efter uppkomsten av covid-19-pandemin gick företaget över till att tillhandahålla PCR-tester för upptäckt av viruset, och blev snabbt en av de största leverantörerna av sådana tester i delstaten. LynxDx tillhandahåller covid-19-tester varje vecka till University of Michigan och Detroit Public Schools Community District .

Publikationer

Delvis lista:

• Hosono Y, Niknafs YS, Prensner JR, Iyer MK, Dhanasekaran SM, Mehra R, Pitchiaya S, Tien J, Escara Wilke J, Poliakov A, Sankar K, Su F, Guo S, Freier SM, Bui H, Cao X, Malik R, Johnson TM, Beer DG, Feng FY, Zhou W, Chinnaiyan AM. Onkogen roll för THOR, en konserverad cancer/testis lång icke-kodande RNA. Cell. 2017.
• YS Niknafs, B. Pandian, T. Gajjar, Z. Gaudette, K. Wheelock, MP Maz, RK Achar, M. Song, C. Massaro, X. Cao, AM Chinnaiyan, MiPanda: A Resource for Analyzing and Visualizing Next- Generation Sequencing Transcriptomics Data, Neoplasia, 2018.
• Niknafs YS, Pandian B, Iyer HK, Chinnaiyan AM, Iyer MK. TACO producerar robusta transkriptomaggregat med flera prover från RNA-seq. Naturmetoder. 2016.
• Niknafs YS, Han S, Ma T, Speers C, Zhang C, Wilder-Romans K, Iyer MK, Pitchiaya S, Malik R, Hosono Y, Prensner JR, Poliakov A, Singhal U, Xiao L, Kregel S, Siebenaler RF, Zhao SG, Uhl M, Gawronski A, Hayes DF, Pierce LJ, Cao X, Collins C, Backofen R, Sahinalp CS, Rae JM, Chinnaiyan AM, Feng FY. LncRNA-landskapet för bröstcancer avslöjar en roll för DSCAM-AS1 i bröstcancerprogression. Naturkommunikation. 2016.
• Shukla S, Zhang X, Niknafs YS, Xiao L, Mehra R, Cieślik M, Ross A, Schaeffer E, Malik B, Guo S, Freier SM, Bui HH, Siddiqui J, Jing X, Cao X, Dhanasekaran SM, Feng FY , Chinnaiyan AM, Malik R Identifiering och validering av PCAT14 som en prognostisk biomarkör i prostatacancer. Neoplasi. 2016.
• Iyer MK, Niknafs YS, Malik R, Singhal U, Sahu A, Hosono Y, Barrette TR, Prensner JR, Evans JR, Zhao S, Poliakov A, Cao X, Dhanasekaran SM, Wu YM, Robinson DR, Beer DG, Feng FY , Iyer HK, Chinnaiyan AM. Landskapet av långa icke-kodande RNA i det mänskliga transkriptomet. Naturgenetik. 19 januari 2015.