Tetrahydrofolat riboswitch
| Tetrahydrofolat riboswitch | |
|---|---|
 Konsensus sekundär struktur för tetrahydrofolat (THF) riboswitch
| |
| Identifierare | |
| Symbol | THF riboswitch |
| Rfam | RF01831 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Riboswitch |
| Domän(er) | Clostridiales , Lactobacillales |
| PDB- strukturer | PDBe |
Tetrahydrofolatriboswitchar är en klass av homologa RNA i vissa bakterier som binder tetrahydrofolat (THF). Det är nästan uteslutande lokaliserat i de troliga 5'-otranslaterade regionerna av proteinkodande gener , och de flesta av dessa gener är kända för att koda för antingen folattransportörer eller enzymer involverade i folatmetabolism . Av dessa skäl drogs slutsatsen att RNA fungerar som riboswitchar . THF-riboswitch finns i en mängd olika Bacillota , särskilt beställningarna Clostridiales och Lactobacillales , och mer sällan i andra linjer av bakterier. THF-riboswitchen var en av många konserverade RNA-strukturer som hittades i ett projekt baserat på jämförande genomik . 3-D-strukturen för tetrahydrofolat-riboswitchen har lösts av separata grupper med hjälp av röntgenkristallografi. Dessa strukturer deponerades i Protein Data Bank under accessions 3SD1 och 3SUX, med andra poster som innehåller varianter.