TMEM241
Transmembranprotein 241 (aka C18orf45, hVVT) är ett allestädes närvarande sockertransportprotein som hos människor kodas av TMEM241-genen.
Gen
Hos människor är TMEM241 en 142 188 bp gen belägen vid 18q11.2 som innehåller 24 exoner.
Gene Neighborhood
TMEM241 ligger nära CABLES1, RIOK3 och NPC1 på kromosom 18.
mRNA
Det primära mRNA:t för humant TMEM241, isoform 1, innehåller en 5' UTR- hårnålsögla bevarad i primater. Det primära mRNA:t för human TMEM241 isoform 1 innehåller bindningsställen i dess 3' UTR för miRNA 520f-5p, 378a-5p och 6866-5p.
Protein
Generella egenskaper
Det finns över 10 transkriptvarianter förutspådda för den humana TMEM241-genen som finns på BLAST. TMEM241 Isoform 1 är ungefär 31 kDa i massa. Proteinet har en isoelektrisk punkt på 8,7. och är särskilt rik på aminosyran fenylalanin, som innehåller två gånger den normala andelen av denna aminosyra.
Bevarade domäner
TMEM241 är sammansatt av 9 transmembrandomäner som bildar en hydrofob integrerad komponent av membranet som huvudsakligen består av alfaspiraler . TMEM241 innehåller en VRG4-domän (Vanadate Resistant Glycosylation) med homologi med sockertransportdomänen VRG4 från Saccharomyces cerevisiae (jäst).
Modifiering efter översättning
TMEM241 förutspås genomgå olika fosforyleringar , glykering , palmitoylering . Till exempel har TMEM241 isoform 1 ett fosforyleringsställe på S6, 64, 170, 177, 291, 295 och 296; glykationsställen på K125, 169 och 172; palmitoyleringsställen på C13, 15, 221.
Interagerande proteiner
Det finns vissa bevis för att detta protein kan interagera med keratinfilament baserat på en tvåhybridscreening med keratinproteinet KRT40.
Uttryck
TMEM241 kommer sannolikt att uttryckas i alla vävnader på varierande nivåer från basal till måttlig expression. Vissa studier har funnit förändringar i uttrycket av TMEM241. Till exempel, i fall av akut megakaryoblastisk leukemi , visade sig TMEM241 vara en av de mest uppreglerade generna. I ett annat fall visade sig TMEM241 vara uppreglerad under det ovikta proteinsvaret efter överuttrycket av Ero1α ( Endoplasmic Reticulum oxidoreduclin 1α).
Homologi
TMEM241 är bevarat i hela eukaryoter.
Ortologer
TMEM241 är bevarad över alla djur och homologer finns i eukaryoter. TMEM241 har 19 % global identitet och 60 % identitet till GDP-mannostransportör från S. cerevisiae , som innehåller VRG4-domänen . Det är troligt att TMEM241 är en GDP-mannostransportör på grund av denna likhet. Grafen till höger visar den relativa nivån av bevarande av TMEM241 över många arter av organismer med hjälp av principen om en molekylär klocka.
| Vetenskapligt namn | Vanligt namn | Avvikelse från H. sapiens (mya) | Proteinlängd (aminosyror) | % Identitet till H. sapiens | Tillträdesnummer |
|---|---|---|---|---|---|
| Homo sapiens | Mänsklig | 0 | 296 | 100 | NP_116322 |
| Mus musculus | Mus | 90,1 | 297 | 84 | NP_001276595 |
| Calidris pugnax | Ruff (fågel) | 320,5 | 296 | 80 | XP_003219697 |
| Python bivittatus | Pytonorm | 320,5 | 296 | 74 | XP_014793906 |
| Xenopus laevis | Groda | 354,4 | 293 | 69 | NP_001091222 |
| Salmo salar | Lax | 436,8 | 296 | 63 | XP_014036453 |
| Bläckfisk bimaculoides | Bläckfisk | 903 | 291 | 35 | XP_014776992 |
| Halyomorpha halys | Stinkbugg | 903 | 257 | 32 | XP_014284006 |
| Saccharomyces cerevisiae | Jäst | 1335,5 | 216 | 25 | AJS02580 |
| Coccomyxa subellipsoidea | Grönalger | 1570,5 | 296 | 28 | XP_005651133 |
Paraloger
TMEM241 har två paraloger hos människor som har homologer genom eukaryoter, UGTREL8 och UGTREL7. TMEM241, UGTREL8 och UGTREL7 är en familj av sockertransportproteiner med nära identitet med GDP-mannostransportören identifierad i S. cerevisiae .
| % identitet | TMEM241 ( H.sapiens) |
UGTREL7 ( H.sapiens) |
UGTREL8 ( H.sapiens) |
BNP Mannose Transporter ( S. cerevisiae) |
|---|---|---|---|---|
| TMEM241 ( H. sapiens) | 100 % | 19,9 % | 23,9 % | 19,0 % |
| UGTREL7 ( H. sapiens) | 19,9 % | 100 % | 52,2 % | 18,8 % |
| UGTREL8 ( H. sapiens) | 23,9 % | 52,2 % | 100 % | 19,9 % |
| BNP Mannose Transporter ( S. cerivisiae) |
19,0 % | 18,8 % | 19,9 % | 100 % |