SonicParanoid

SonicParanoid är en algoritm för de-novo förutsägelse av ortologa gener bland flera arter. Den lånar huvudidén från InParanoid med betydande förändringar av algoritmen som drastiskt minskar tiden som krävs för analysen. Dessutom genererar SonicParanoid grupper av ortologa gener som delas mellan ingångsproteomerna med hjälp av enkellänkning av hierarkisk klustring eller markov-klustring.