SAM-Chlorobi RNA-motiv
| SAM-Chlorobi RNA | |
|---|---|
 Konsensus sekundär struktur för SAM-Chlorobi RNA-
| |
| identifierare | |
| Symbol | SAM-klorobi-RNA |
| Rfam | RF01724 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Cis -reglerande element |
| Domän(er) | Klorobiota |
| PDB- strukturer | PDBe |
SAM -Chlorobi RNA-motivet är en konserverad RNA- struktur som identifierades av bioinformatik . RNA:n finns endast i bakterier som klassificeras som inom phylum Chlorobiota . Dessa RNA finns alltid i de 5'-otranslaterade regionerna av operoner som innehåller metK- och ahcY -gener. metK- gener kodar för metioninadenosyltransferas , som syntetiserar S-adenosylmetionin (SAM), och ahcY -gener kodar för S-adenosylhomocysteinhydrolas , som bryter ned den relaterade metaboliten S-Adenosyl-L-homocystein (SAH). Faktum är att alla förutsagda metK- och ahcY -gener inom Chlorobiota-bakterier från och med 2010 föregås av förutspådda SAM-Chlorobi-RNA. Förutsagda promotorsekvenser återfinns konsekvent uppströms om SAM-Chlorobi-RNA, och dessa promotorsekvenser antyder att SAM-Chlorobi-RNA verkligen transkriberas som RNA. Promotorsekvenserna är vanligen förknippade med stark transkription i phyla Chlorobiota och Bacteroidota , men används inte av de flesta linjer av bakterier. Placeringen av SAM-Chlorobi RNA antyder att de är involverade i regleringen av metK/ahcY -operonen genom en okänd mekanism.
externa länkar