Robert J. Schmitz
Robert J. Schmitz | |
|---|---|
| Född | 1980 |
| Medborgarskap | Förenta staterna |
| Utbildning | Salk Institutet |
| Alma mater | University of Arizona , University of Wisconsin, Madison |
| Känd för | Skapar epigenetiska rekombinanta inavlade linjer. |
| Vetenskaplig karriär | |
| Fält | Genomik , Epigenetik , Växtbiologi |
| institutioner | University of Georgia |
| Avhandling | Vernalisering: en modell för att undersöka epigenetik och eukaryot genreglering i Arabidopsis thaliana ( 2007) |
| Doktorandrådgivare | Richard Amasino |
| Andra akademiska rådgivare | Joseph R. Ecker |
| Hemsida | |
Robert J. Schmitz är en amerikansk växtbiolog och epigenomiker vid University of Georgia där han studerar genereringen och de fenotypiska konsekvenserna av växtepialleler samt utvecklar nya tekniker för att identifiera och studera cis-regulatoriska sekvenser. Han är docent vid institutionen för genetik och UGA Foundation Endowed Pant Sciences Professor.
Utbildning och karriär
Schmitz gick på University of Arizona för sina kandidatexamen och University of Wisconsin för sin doktorsexamen. Som doktorand arbetade han i Richard Amasinos labb och studerade rollen av epigenetiska modifieringar på vernalisering i Arabidopsis thaliana . Han tog examen från Wisconsin 2007. Från 2007 till 2013 var han postdoktor hos Joe Ecker vid Salk Institute . 2013 anställdes han som biträdande professor vid institutionen för genetik vid University of Georgia-Athens där han fortsätter att arbeta som docent och chef för Georgia Genomics & Bioinformatics Core.
Forskning
Som postdoc utvecklade Schmitz teknologier för att bestämma metyleringsstatusen för enskilda cytosiner i växtgenom med hjälp av sekvenseringsteknologier och använde dem för att kvantifiera hur metyleringsmönstret varierade mellan olika individer av samma art. Han använde samma teknik för att kartlägga segregerande differentiellt metylerade regioner i rekombinanta inavlade populationer av sojabönor, att hitta underliggande genetisk haplotyp inte konsekvent förutsäga vilken förälders metyleringstillstånd som skulle observeras i en given genotyp. Han visade att förlusten av Chromomethylase 3, ett växtmetyltransferas, upphäver genkroppsmetylering och att denna förlust har inträffat upprepade gånger hos vilda växtarter.
Hans forskargrupp arbetar med att använda epigenetisk variation för att modifiera växternas fenotyp. De arbetar med naturligt förekommande epimutationer men har också utvecklat uppsättningar av epi-RIL som har identiskt DNA men olika DNA-metylering. Genom att använda ett enzym från människor kan de ta bort metyleringen från specifikt riktade gener i växter, och väcka gener som länge har varit vilande i genomet.
Han arbetar också med att tillämpa epigenomprofilering för upptäckten av icke-kodande regulatoriska sekvenser i olika växtarter. Hans labb identifierade cis-reglerande element i majs som kontrollerar uttrycket av gener som är belägna långa avstånd bort i genomet. De kombinerar ATAC-seq med fluorescensaktiverad kärnsortering för att identifiera platserna för öppna kromatinregioner och transkriptionsfaktorbindningsställen i växtgenom.
Erkännande
- Pew Biomedical Scholar (2015)
- Hans Fischer Fellow, Technical University of München (2018)
externa länkar
- Robert J. Schmitz publikationer indexerade av Google Scholar
