rne-II RNA-motiv
| rne-II RNA | |
|---|---|
 Konsensus sekundär struktur för rne -II RNA
| |
| identifierare | |
| Symbol | rne-II RNA |
| Rfam | RF01756 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Cis -reglerande element |
| Domän(er) | Pseudomonadaceae |
| PDB- strukturer | PDBe |
rne -II RNA-motivet är en konserverad RNA- struktur identifierad med hjälp av bioinformatik . Det påvisas endast hos arter som klassificeras inom familjen Pseudomonadaceae , en grupp gammaproteobakterier . rne -II RNA är konsekvent lokaliserade i de förmodade 5' otranslaterade regionerna (5' UTR) av gener som kodar för ribonukleas E (RNas E). RNase E 5' UTR-elementet är en tidigare identifierad RNA-struktur som också finns i 5' UTR:erna av RNas E-gener. Det senare motivet finns emellertid endast i enterobakterier , och de två motiven har uppenbarligen orelaterad struktur. Med tanke på deras skillnader antogs det att rne -II-RNA fyller samma funktionella roll som RNase E 5' UTR-element, vilket är att reglera nivåerna av RNas E- proteiner genom att fungera som ett substrat för RNas E. När koncentrationer alltså av RNas E är höga, kommer de att bryta ned sitt eget budbärar-RNA .
externa länkar