PFW började sin verksamhet den 1 juli 2018 efter upplösningen av Indiana University – Purdue University Fort Wayne (IPFW), som hade varit ett gemensamt campus för Indiana University och Purdue University systemen. IPFW:s akademiska program inom hälsovetenskap överfördes till det nya Indiana University Fort Wayne , där alla andra akademiska program togs över av PFW. IPFW-idrottsprogrammet, märkt som "IPFW" till och med 2015–16 och "Fort Wayne" 2016–17 och 2017–18, överfördes i sin helhet till PFW, och antog det nuvarande atletiska varumärket "Purdue Fort Wayne" vid den tiden . Historien om PFW herrbasketboll börjar alltså med IPFW:s första säsong av interkollegial tävling 1973–74.
En betydande komplikation i statistisk registrering är att Mastodonterna har varit medlemmar i alla tre nuvarande NCAA-divisioner. IPFW var från början medlem i NCAA Division III (av en slump under den första säsongen då NCAA antog sin nuvarande tredivisionsuppställning). Universitetet flyttade till division II från och med säsongen 1982–83 och sedan till division I med start 2001–02.
I division II spelade NCAA inte officiellt in assist som statistik förrän säsongen 1988–89, och blockeringar och stjäl fram till säsongen 1992–93 (detta var flera år efter att samma statistik registrerades i DI). Medan flera konferenser experimenterade med trepoängare tidigare på 1980-talet, startade officiella NCAA-rekord för trepoängsskytte för alla divisioner med säsongen 1986–87, då användningen av trepoängaren gjordes obligatorisk under hela NCAAs basketboll för män med avståndet som uniform över hela sporten.
PFW:s rekordböcker för enspelsföreställningar inkluderar endast prestationer under programmets DI-era, och trepoängsrekord för säsong och karriär dateras endast till det nationella antagandet av trepoängaren. PFW-rekordböckerna inkluderar ledare i alla andra statistiska kategorier under alla säsonger, oavsett om NCAA officiellt registrerade denna statistik under de relevanta säsongerna. Dessa listor uppdateras genom Mastodons förlust mot Detroit Mercy i den första omgången av 2023 års Horizon League-turnering . Aktuella spelare visas med fet stil ; Observera att PFW är kvalificerad att delta i sekundära nationella turneringar säsongen 2022–23.