psaA RNA-motiv
| psaA RNA | |
|---|---|
 Konsensus sekundär struktur för psaA RNA
| |
| identifierare | |
| Symbol | psaA RNA |
| Rfam | RF01752 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Cis -reglerande element |
| Domän(er) | cyanobakterier |
| PDB- strukturer | PDBe |
psaA RNA - motivet beskriver en klass av RNA med en gemensam sekundär struktur . psaA- RNA finns uteslutande på platser som förmodligen motsvarar de 5'-otranslaterade regionerna av operoner bildade av psaA- och psaB -gener . Av denna anledning antogs det att psaA -RNA fungerar som cis-regulatoriska element i dessa gener. psaAB - generna kodar för proteiner som bildar subenheter i fotosystem I - strukturen som används för fotosyntes . psaA- RNA har endast detekterats i cyanobakterier , vilket överensstämmer med deras samband med fotosyntes.
psaAB -gener är kända för att regleras i arter av cyanobakterier som inte använder psaA -RNA, och detta regleringssystem involverar transkriptionsfaktorproteiner . I detta system ökar uttrycket av psaAB -gener när celler växer med begränsad mängd ljus, förmodligen för att maximera sin energi från den begränsade resursen. Å andra sidan minskar genernas uttryck när ljusnivåerna är höga, vilket antas minska skador som kan orsakas av fria radikaler som är en biprodukt av fotosyntesen. En region av psaA RNA-motivet motsvarar den förväntade sekvensen av ett bindningsställe för NtcA-proteinet, som är involverat i kvävereglering.
Strukturellt består psaA RNA-motivet av ett något komplext arrangemang av stammar som är ett resultat av basparning, och många stamslingor avslutas av den stabila UNCG- tetraloopen . De flesta av de konserverade nukleotiderna i motivet deltar i standard Watson-Crick-baspar. Men eftersom den exakta funktionen av psaA RNA är okänd, är det också okänt vilken biokemisk roll dessa egenskaper spelar.