Partick Thistles debut i europeisk fotboll kom 1963–64 när de kvalificerade sig till Inter-Cities Fairs Cup efter att ha slutat trea i den skotska förstadivisionen bakom Rangers respektive Kilmarnock . Deras första omgångsmotståndare var Glentoran från Nordirland . Thistle vann bortamatchen i Belfast med 4–1. I den andra omgången hemma producerade de en 3–0-seger för att gå vidare till nästa omgång bekvämt med 7–1 sammanlagt. I den andra omgången mötte de den tjeckoslovakiska klubben Spartak Brno . Första matchen spelades hemma på Thistle vann oavgjort med 3–2. På bortakampen producerade Spartak Brno dock en övertygande 4–0-seger och slog ut Partick Thistle med 6–3 sammanlagt.
Thistle kvalificerade sig för UEFA-cupen för första och enda gången 1972–73 efter att ha besegrat Celtic i finalen i Scottish League Cup föregående säsong. De mötte Budapest Honvéd från Ungern i den första omgången. I den första matchen förlorade Thistle med 1–0 på Bozsik József Stadion i Budapest. I returen på Firhill blev de också slagen, denna gång 3–0 för att lämna turneringen med 4–0 sammanlagt.
1995 tävlade Thistle i UEFA Intertoto Cup. De lottades i grupp 6 tillsammans med Keflavík , LASK Linz , Metz och NK Zagreb . Varje lag spelade mot varandra en gång, antingen hemma eller borta. Thistle första match var mot LASK Linz i Österrike som slutade oavgjort 2–2. Deras nästa match var mot isländska Keflavík hemma i Glasgow och slutade med en 3–1-seger. Thistle mötte sedan franska klubben Metz på bortaplan vilket resulterade i en knapp 1–0-förlust. Deras sista match var mot NK Zagreb från Kroatien på hemmaplan och förlorade knappt med 2–1. Thistle slutade fyra totalt i grupp 6 vilket inte räckte för att kvalificera sig till nästa omgång. Metz gick vidare till utslagsstadiet efter att ha hamnat i toppen av gruppen med maximala poäng efter att ha vunnit alla sina matcher.