Michael Antonio Savageau

Michael A. Savageau
MAS2 2020.jpg
Född ( 1940-12-03 ) 3 december 1940 (82 år)
Nationalitet amerikansk
Utbildning

University of Minnesota ( BS ), University of Iowa ( MS ), Stanford University ( PhD )
Känd för


Biokemisk systemteori , matematiskt kontrollerad jämförelse, designrumsmetod, fenotypcentrerad modellering
Vetenskaplig karriär
institutioner University of California, Davis
Doktorand rådgivare RD Smallwood
Influerad Eberhard Voit
Hemsida savageaulab .bme .ucdavis .edu

Michael A. Savageau (född 3 december 1940) är en framstående professor vid institutionerna för mikrobiologi och molekylär genetik och biomedicinsk teknik vid University of California, Davis . Han utsågs till Fellow vid Institute of Electrical and Electronics Engineers ( IEEE) 2013 för tillämpning av systemteknikkoncept på molekylärbiologi .

tidigt liv och utbildning

Michael Antonio Savageau, ett av sju barn, föddes i Fargo , North Dakota den 3 december 1940. Hans far var frisör och hans mamma var lärare. Han var en ivrig hockey- och tennisspelare genom gymnasiet, och han har tillskrivit idrotten att han lärt honom värdefullt liv och professionella färdigheter. Han kämpade med odiagnostiserad dyslexi under hela sin akademiska karriär, men han utvecklade kompensatoriska strategier. Han kunde till exempel inte göra anteckningar i föreläsningslektioner, så han utvecklade en formidabel koncentrations- och minnesförmåga. Hans dyslexi väckte hans intresse för matematik och han utmärkte sig i de klasserna. Savageau tog examen från Fargo Central High School 1958 och fortsatte med sin Bachelor of Science- examen i ingenjörsvetenskap från University of Minnesota 1962 och en Master of Science -examen från University of Iowa 1963. Han antogs till Ph. D. program i elektroteknik vid Stanford University 1963, och det var där han började utveckla sitt intresse för att tillämpa tekniska principer och metoder på biologiska system. Savageau var postdoktor vid både University of California, Los Angeles (1967 - 1968, i professor Isaac Hararys laboratorium) och Stanford University (1968 - 1970, i professor JP Stewards laboratorium) innan han började på fakulteten vid University of Michigan 1970. Han initierade Michigans tvärvetenskapliga utbildningsprogram i cellulär bioteknik och dess tvärvetenskapliga bioinformatikprogram. Han var också ordförande vid Institutionen för mikrobiologi och immunologi från 1979 till 1985 och från 1992 till 2002 och utnämndes till Nicolas Rashevsky Distinguished University Professor 2002. Efter att ha flyttat till University of California, Davis 2003 var han ordförande för Institutionen för biomedicinsk teknik från 2005 till 2008

Privatliv

Savageau träffade studiekamraten Ann Birky, (för närvarande Ann Savageau, konstnär och professor i konst och design), på Stanford och de gifte sig 1967. De fostrade sin familj i Ann Arbor, Michigan , där båda hade fakultetstjänster vid The University of Michigan . De fick tre barn, Mark, Patrick och Elisa, som alla har föregått dem i döden. De hjälper till att fostra sina barnbarn i Davis , Kalifornien .

Pris och ära

Dr Savageaus utmärkelser inkluderar Guggenheim Fellow, Fulbright Senior Research Fellow, Michigan Society of Fellows, American Academy of Microbiology Fellow, Foundation for Microbiology Lektor, American Association for the Advancement of Science Fellow, American Institute for Medical and Biological Engineering Fellow, Institute of Electrical och Electronics Engineers Fellow, Moore Distinguished Scholar vid California Institute of Technology , Institut des Hautes Études Scientifiques Award, 79:e Josiah Willard Gibbs lektor för American Mathematical Society, Stanislaw Ulam Distinguished Scholar Award från Center for Non-Linear Studies, Los Alamos National Laboratory , medlem av US National Academy of Medicine , hedersdoktor i vetenskapen, Universitat de Lleida , Spanien, Michael A. Savageau Collegiate Professorship i Computational Medicine and Bioinformatics permanent begåvad av University of Michigan , och Akira Okubo-priset.

Utvalda publikationer

Dr Savageaus vetenskapliga karriär inkluderar en bok och över 170 referentgranskade vetenskapliga publikationer, som täcker olika matematiska och biologiska frågor. Nedan listas några av hans nyckelpublikationer, sorterade efter ämne.

Biokemisk systemteori

  • Savageau, MA (1969). Biokemisk systemanalys: I. Några matematiska egenskaper hos hastighetslagen för komponentenzymatiska reaktioner. J. Theor. Biol. 25 , 365-369.
  • Savageau, MA (1969). Biokemisk systemanalys: II. Steady-state-lösningarna för ett n-pool-system med hjälp av en kraftlagsapproximation. J. Theor. Biol. 25 , 370-379.
  • Savageau, MA (1970). Biokemisk systemanalys: III. Dynamiska lösningar som använder en approximation av kraftlagar. J. Theor. Biol. 26 , 215-226.
  • Savageau, MA, Voit, EO (1987). Omarbeta olinjära differentialekvationer som S-system: en kanonisk olinjär form. Matematik. Biosci. 87 , 83-115.
  • Savageau, MA (1971). Parameterkänslighet som ett kriterium för att utvärdera och jämföra prestandan hos biokemiska system. Nature 229 , 542-544.

Genkretsar och designprinciper

  • Savageau. MA (1974). Jämförelse av klassiska och autogena regleringssystem i inducerbara operoner. Nature 252 , 546-549.
  • Hlavacek, WS, Savageau, MA (1996). Regler för kopplat uttryck av regulator- och effektorgener i inducerbara kretsar. J. Mol. Biol. 255 , 121-139.
  • Savageau, MA (2001). Designprinciper för elementära genkretsar: Element, metoder och exempel. Chaos 11 , 142-159.
  • Atkinson, MR, Savageau, MA, Myers, JT, Ninfa, AJ (2003). Utveckling av genetiska kretsar som uppvisar vippbrytare eller oscillerande beteende i Escherichia coli. Cell 113 , 597-607.
  • Wall, ME, Hlavacek, WS, Savageau, MA (2004). Design av genkretsar: lärdomar från bakterier. Nat. Rev. Genet. 5 , 34-42.

Metod för matematiskt kontrollerad jämförelse

  • Savageau, MA (1972). Beteendet hos intakta biokemiska kontrollsystem. Curr. Topp. Cell. Reg. 6 , 63–130.
  • Savageau, MA (1974). Optimal design av återkopplingskontroll genom inhibering: steady-state överväganden. J. Mol. Evol., 4 , 139-156.
  • Irvine, DH och Savageau, MA (1985). Nätverksreglering av immunsvaret: alternativa kontrollpunkter för suppressormodulering av effektorlymfocyter. J. Immunol., 134 , 2100-2116.
  • Hlavacek, WS och Savageau, MA (1996) Regler för kopplat uttryck av regulator- och effektorgener i inducerbara kretsar. J. Mol. Biol. 255 , 121-139.
  • Alves, R., Savageau, MA (2000). Utvidga metoden för matematiskt kontrollerad jämförelse till att omfatta numeriska jämförelser. Bioinformatics 16 , 786–798.

Design Space Approach, Design Space Toolbox och Fenotyp-centrerad modelleringsstrategi

  • Savageau, MA, Coelho, PMBM, Fasani, RA, Tolla, DA, Salvador, A. (2009). Fenotyper och toleranser i designutrymmet för biokemiska system. PNAS 106 , 6435-6440.
  • Fasani, RA, Savageau, MA (2010). Automatiserad konstruktion och analys av designutrymmet för biokemiska system. Bioinformatics 26 , 2601-2609.
  • Lomnitz, JG, Savageau, MA (2016). Design Space Toolbox V2: automatiserad programvara som möjliggör en ny fenotypcentrerad modelleringsstrategi för naturliga och syntetiska biologiska system. Främre. Genet. 7 , 118.
  • Valderrama-Gómez, MA, Parales, RE, Savageau, MA (2018). Fenotypcentrerad modellering för klargörande av biologiska designprinciper. J. Theor. Biol. 455 , 281-292.
  • Valderrama-Gómez, MA, Lomnitz, JG, Fasani, RA, Savageau, MA (2020). Mekanistisk modellering av biokemiska system utan a priori parametervärden med hjälp av Design Space Toolbox v. 3.0. iScience 101200.

Böcker

  • Biochemical Systems Analysis: A Study of Function and Design in Molecular Biology, Addison-Wesley 1976.