MicF RNA
| MicF RNA | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av MicF
| |
| -identifierare | |
| Symbol | MicF |
| Rfam | RF00033 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen ; antisens |
| Domän(er) | Bakterie |
| GÅ | GO:0006950 GO:0003729 |
| SÅ | SO:0000383 |
| PDB- strukturer | PDBe |
micF- RNA är en icke-kodande RNA- stressresponsgen som finns i Escherichia coli och relaterade bakterier som post-transkriptionellt kontrollerar uttrycket av den yttre membranporingenen ompF. micF-genen kodar för ett icke-translaterat antisens-RNA på 93 nukleotider som binder dess mål-ompF- mRNA och reglerar ompF-uttryck genom att hämma translation och inducera nedbrytning av meddelandet. Dessutom spelar andra faktorer, såsom RNA-chaperonproteinet StpA också en roll i detta regulatoriska system. Uttrycket av micF styrs av både miljömässiga och interna stressfaktorer. Fyra transkriptionella regulatorer är kända för att binda micF-promotorregionen och aktivera micF-uttryck.
Artfördelning
Homologer av MicF RNA har karakteriserats av Southern blotting i en mängd olika bakterier inklusive Salmonella typhimurium , Klebsiella pneumoniae och Pseudomonas aeruginosa . MicF har också identifierats beräkningsmässigt i Yersinia pestis och Yersinia enterocolitica .