Mesoplasma florum riboswitch
| Mesoplasma florum riboswitch | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av MFR-
| |
| identifierare | |
| Symbol | MFR |
| Rfam | RF01510 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Cis-reg ; riboswitch |
| Domän(er) | Bakterier ; |
| GÅ | GO:0032546 GO:0031554 |
| SÅ | SO:0000035 |
| PDB- strukturer | PDBe |
Riboswitchar är cis-verkande regulatoriska element belägna inom 5' UTR av mRNA -transkript. Dessa regulatoriska element binder små molekyler vilket resulterar i en konformationsförändring inom 5'UTR av mRNA. Förändringarna i mRNA:s sekundära struktur resulterar därefter i förändringar i uttrycket av den intilliggande öppna läsramen .
Bioinformatiska studier har identifierat flera riboswitch som finns i M. florum . Dessa riboswitchar har kartlagts till regioner belägna uppströms om guaAB-operonet och liknar purinriboswitchar . Riboswitcharna som identifierats i M. florum kan klassas som nya riboswitch eftersom de avviker i sekvens och struktur inom slingregionerna som krävs för aptamerbindning jämfört med konventionella purinriboswitchar. Mutagenes bekräftade att ändrade nukleotider inom loopregionerna av denna riboswitch förändrade specificiteten för ligandbindning. Denna studie visade att de nya riboswitcharna har en större mångfald i ligander som de binder eftersom de visade sig binda alternativa ligander som nukleosider . De nya riboswitcharna visades alla ligga uppströms om en förmodad inneboende terminatorstam och detta indikerar att dessa riboswitchar kontrollerar transkriptionsterminering . Jämförande genomik har visat att dessa nya riboswitch endast finns i M. florum och inte finns i andra bakteriestammar.