Lysin riboswitch
| Lysinriboswitch | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering lysinriboswitchidentifierare
| |
| av | |
| Symbol | Lysin |
| Rfam | RF00168 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Cis-reg ; riboswitch |
| Domän(er) | Bakterie |
| SÅ | SO:0000035 |
| PDB- strukturer | PDBe |
Lysinriboswitchen är ett metabolitbindande RNA-element som finns i vissa budbärar-RNA som fungerar som en precisionssensor för aminosyran lysin . Allosterisk omarrangemang av mRNA-strukturen medieras av ligandbindning, och detta resulterar i modulering av genuttryck . Lysin riboswitch är mest förekommande i Bacillota och Gammaproteobacteria där de finns uppströms om ett antal gener involverade i lysinbiosyntes, transport och katabolism. Lysinriboswitchen har också identifierats oberoende och kallas L-boxen.
Strukturera
Strukturen för lysinriboswitchen har nyligen bestämts. Lysinaminosyran är bunden i fickan som bildas av 5-vägsövergången. Strukturen är sammansatt av en tre-spiralformad bunt och en två-spiralformad bunt förenade av 5-vägsövergången. Helixarna 1 och 2 är staplade på ett kolineärt sätt liksom spiralerna 4 och 5.
![A 3D representation of the lysine riboswitch with a bound lysine molecule shown in space filling spheres.[6]](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f3/Lys_ribosw_1.jpg/57px-Lys_ribosw_1.jpg)
En 3D-representation av lysinriboswitchen med en bunden lysinmolekyl som visas i rymdfyllande sfärer.
![A 3D representation of the lysine riboswitch with a bound lysine molecule shown in space filling spheres.[6]](https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Lys_ribosw_1.jpg)