Han började sin collegefotbollskarriär i Arkansas State . Efter röd tröja 2016 spelade han för Arkansas State fotbollslag från 2017 till 2020. Han fick en kandidatexamen i sport management från Arkansas State.
Utah State
År 2021 följde Bonner Arkansas State tränare Blake Anderson till Utah State och registrerade sig där som doktorand. Under säsongen 2021 genomförde han 263 av 429 passningar för 3 628 yards och 36 touchdowns. Hans 2021 totala 3 628 passningsyards och 36 touchdowns satte nya rekord i Utah State.
Bonner återvände till Utah State för sin sjätte säsong av collegefotboll 2022. I juli 2022 utsågs han till Maxwell Award-bevakningslistan. Hans säsong 2022 slutade i slutet av september på grund av en fotskada mot UNLV. Han avslutade säsongen med 753 passningsyards med sex touchdowns, åtta interceptions och en fullbordandegrad på 56,8%.