Kapitlen i Kobato är skrivna och illustrerade av Clamp och dök först upp som en serie i Shogakukan 's Monthly Sunday Gene-X magazine. 2006 flyttades serien till Newtype av företaget Kadokawa Shoten . Mangan avslutade serialiseringen i augusti-numret 2011 från Newtype som publicerades i juli 2011. Kadokawa släppte tankōbon- volymerna från 26 december 2007 till 26 augusti 2011.
Den 4 april 2007 tillkännagav Newtype USA ett speciellt avtal med Clamp för att exklusivt serialisera Kobato. , på tidningens sidor. Kobato började sin serieupplaga i juninumret 2007 av Newtype USA och skulle fortsätta sin exklusiva serialisering till och med majnumret 2008, omfattande 12 omgångar totalt. Newtype USA upphörde dock publiceringen med februarinumret 2008, efter att ha seriefört 9 av de 12 omgångarna. Den 24 juli 2009 Yen Press att de hade förvärvat licensen att publicera Kobato på engelska i Nordamerika under deras panel på San Diego Comic-Con International . Mangan släpptes i Nordamerika i maj 2010 för att hedra CLAMPs 20-årsjubileum. I Europa licensierades serien av Pika Édition för Frankrike, JPF för Polen och Norma Editorial för Spanien.