Lindemann index

Lindemann -indexet är ett enkelt mått på termiskt driven störning i atomer eller molekyler. Det lokala Lindemann-indexet definieras som:

$q_{i}={\frac {1}{N-1}}\ summa _{j\neq i}{\frac {\sqrt {\langle r_{ij}^{2}\rangle -\langle r_{ij}\rangle ^{2}}}{\langle r_{ij}\ rangle }}$

där vinkelparenteser indikerar ett tidsgenomsnitt. Det globala Lindemann-indexet är ett systemgenomsnitt av denna kvantitet.

Inom den kondenserade materiens fysik tas ofta

ett avsteg från linjäriteten i beteendet hos det globala Lindemann-indexet eller en ökning över ett tröskelvärde relaterat till avståndet mellan atomer (eller miceller , partiklar, kulor, etc.) som en indikation på att en fast- vätskefasövergång har ägt rum . Se Lindemanns smältkriterium .

Biomolekyler

har ofta separata regioner med olika ordningsegenskaper. För att kvantifiera eller illustrera lokal störning kan det lokala Lindemann-indexet användas.

Försiktighet måste iakttas om molekylen har en globalt definierad dynamik, till exempel kring ett gångjärn eller pivot, eftersom dessa rörelser kommer att skymma de lokala rörelser som Lindemann-indexet är utformat för att kvantifiera. En lämplig taktik i denna omständighet är att summera r _ij endast över ett litet antal närliggande atomer för att komma fram till _varje qi . Ytterligare en mängd sådana modifieringar av Lindemann-indexet finns tillgängliga och har olika förtjänster, t.ex. för studiet av glasartade kontra kristallina material.