Klubben grundades 1906, vilket gör den till den näst äldsta fotbollsklubben i Malmö efter IFK Malmö . Kvarnby IK har sedan grundandet huvudsakligen deltagit i de lägre divisionerna i det svenska seriesystemet . Klubben har upplevt en glansperiod de senaste åren tre gånger under de senaste tre åren, från division 5 2007 till division 2 2010. De spelar sina hemmamatcher på Bäckagårds IP i Malmö.
Från och med 2018-08-18 Obs: Flaggor indikerar landslag enligt definitionen under FIFA:s behörighetsregler . Spelare kan ha mer än en icke-FIFA-nationalitet.
Från och med 2011-04-20 Obs: Flaggor indikerar landslag enligt definitionen under FIFA:s behörighetsregler . Spelare kan ha mer än en icke-FIFA-nationalitet.