Kromosom mikrodissektion
Kromosommikrodissektion är en teknik som fysiskt tar bort en stor del av DNA från en komplett kromosom . Den minsta delen av DNA som kan isoleras med denna metod omfattar 10 miljoner baspar - hundratals eller tusentals individuella gener .
Forskare som studerar kromosomer är kända som cytogenetiker . De kan identifiera varje kromosom baserat på dess unika mönster av mörka och ljusa band. Vissa avvikelser gör dock att kromosomerna har ovanliga bandmönster. Till exempel kan en kromosom ha en bit av en annan kromosom insatt i sig, vilket skapar extra band. Eller så kan en del av en kromosom upprepas om och om igen, vilket resulterar i ett ovanligt brett, mörkt band (känd som en homogent färgande region ). Vissa kromosomavvikelser har kopplats till cancer och ärftliga genetiska störningar, och kromosomerna i många tumörceller uppvisar oregelbundna band. För att förstå mer om vad som orsakar dessa tillstånd hoppas forskare kunna avgöra vilka gener och DNA-sekvenser som finns nära dessa ovanliga band. Kromosommikrodissektion är ett specialiserat sätt att isolera dessa regioner genom att ta bort DNA från bandet och göra det DNA tillgängligt för vidare studier.
För att förbereda celler för kromosommikrodissektion behandlar en vetenskapsman dem först med en kemikalie som tvingar dem in i metafas : en fas av cellens livscykel där kromosomerna är tätt hoprullade och mycket synliga. Därefter släpps cellerna på ett objektglas så att kärnan, som håller ihop allt genetiskt material, bryts isär och släpper ut kromosomerna på objektglaset. Sedan, under ett mikroskop, lokaliserar forskaren det specifika bandet av intresse, och med hjälp av en mycket fin nål, river bandet bort från resten av kromosomen. Forskaren producerar sedan flera kopior av det isolerade DNA:t med hjälp av en procedur som kallas PCR ( polymeraskedjereaktion) . Forskaren använder dessa kopior för att studera DNA från den ovanliga regionen av kromosomen i fråga.
- Scalenghe F, Turco E, Edstrom JE, Pirrotta V, Melli M.: Mikrodissektion och kloning av DNA från en specifik region av Drosophila melanogaster polytene kromosomer. Kromosom. 1981;82(2):205-16.