Konvergent korsmappning
Convergent cross mapping ( CCM ) är ett statistiskt test för ett orsak-och-verkan-samband mellan två variabler som, liksom Granger-kausalitetstestet , försöker lösa problemet att korrelation inte innebär orsakssamband . Medan Granger-kausalitet är bäst lämpad för rent stokastiska system där orsaksvariablernas influenser är separerbara (oberoende av varandra), bygger CCM på teorin om dynamiska system och kan appliceras på system där kausala variabler har synergistiska effekter. Som sådan är CCM specifikt inriktat på att identifiera kopplingar mellan variabler som kan verka okorrelerade med varandra.
Teori
Om man har tillgång till systemvariabler som tidsserieobservationer kan Takens inbäddningssats tillämpas . Takens teorem bevisar generellt att tillståndsrummet för ett dynamiskt system kan rekonstrueras från en enda observerad tidsserie av systemet, . Detta rekonstruerade eller skugggrenrör är diffeomorft till det sanna grenröret och bevarar de inneboende egenskaperna för tillståndsrymd för i .
Convergent Cross Mapping (CCM) utnyttjar en följd av Generalized Takens Theorem att det borde vara möjligt att korsförutsäga eller korsa kartan mellan variabler observerade från samma system. Antag att i något dynamiskt system som involverar variablerna och orsakar displaystyle . Eftersom och tillhör samma dynamiska system, mappas även deras rekonstruktioner via inbäddningar och till samma system.
Orsaksvariabeln lämnar en signatur på den påverkade variabeln och följaktligen kan de rekonstruerade tillstånden baserade på användas för att korsprediktera värden på . CCM utnyttjar den här egenskapen för att härleda kausalitet genom att förutsäga med hjälp av biblioteket med punkter (eller vice versa för den andra kausalitetsriktningen), samtidigt som man utvärderar förbättringar av förutsägbarheten över kartan eftersom större och större slumpmässiga urval av används. Om prediktionsförmågan för ökar och mättas när hela används, ger detta bevis för att kausalt påverkar .
Korsmappning är i allmänhet asymmetrisk. Om tvingar enkelriktat, kommer variabel att innehålla information om , men inte vice versa. Följaktligen kan tillståndet för förutsägas från , men kommer inte att vara förutsägbart från .
Algoritm
De grundläggande stegen för konvergent korsmapping för en variabel med längden mot variabel är:
- Om det behövs, skapa tillståndsutrymmesgrenröret från
- Definiera en sekvens av biblioteksdelmängder som sträcker sig från en liten del av till nära .
- Definiera ett antal ensembler att utvärdera vid varje biblioteksstorlek.
- Vid varje biblioteksdelmängd storlek :
- För ensembler:
- Välj slumpmässigt tillståndsvektorer från
- Uppskatta från den slumpmässiga delmängden av med hjälp av Simplex -tillståndsförutsägelsen
- Beräkna korrelationen mellan och
- Beräkna medelkorrelationen över ensemblerna vid
- För ensembler:
- Spektrum av kontra måste uppvisa konvergens.
- Bedöma betydelse. En teknik är att jämföra med beräknade från slumpmässiga realisationer ( surrogat) av .
Ansökningar
- Visar att den uppenbara korrelationen mellan sardin och ansjovis i Kalifornienströmmen beror på delad klimatpåverkan och inte direkt interaktion.
- Härleda orsaksriktningen mellan grupper av nervceller i hjärnan.
- Att reda ut hjärnans dynamik i medvetandet.
- Analyserar potentiella miljödrivande orsaker till malariafall i nordvästra Argentina.
- Miljökontextberoende i artinteraktioner.
Tillägg
Tillägg till CCM inkluderar:
- Utökad konvergent korsmapping
- Konvergent korssortering
Se även
Vidare läsning
-
Chang, CW., Ushio, M. & Hsieh, Ch. (2017). "Empirisk dynamisk modellering för nybörjare" . Ecol Res . 32 (6): 785–796. doi : 10.1007/s11284-017-1469-9 .
{{ citera tidskrift }}
: CS1 underhåll: flera namn: lista över författare ( länk ) -
Stephan B Munch, Antoine Brias, George Sugihara , Tanya L Rogers (2020). "Vanliga frågor om olinjär dynamik och empirisk dynamisk modellering" . ICES Journal of Marine Science . 77 (4): 1463–1479. doi : 10.1093/icesjms/fsz209 .
{{ citera tidskrift }}
: CS1 underhåll: flera namn: lista över författare ( länk )
externa länkar
Animationer: