Klarisa Rikova

Klarisa Rikova är senior forskare vid Cell Signaling Technology , Inc. (CST) i Danvers, Massachusetts. Hon har arbetat på CST sedan 2000 och arbetade som vetenskapsman på CST:s systerföretag, Bluefin Biomedicine i Beverly, Massachusetts, från 2015 till 2019.

tidigt liv och utbildning

Rikova växte upp i Tasjkent , Uzbekistan. Hon gick på National University of Uzbekistan där hon tog sin M.Sc. i kemi. Rikova anställdes 2000 som vetenskapsman på Cell Signaling Technology, Inc. Från 2015 till 2019 arbetade hon som vetenskapsman på Bluefin Biomedicine innan hon återigen började på CST som senior vetenskapsman.

Forskning och karriär

Cell Signaling Technology, Inc. använde en ny form av sannolikhetsbaserad masspektroskopi för att analysera posttranslationella modifieringar bland peptider tagna från tumörcellinjer. Detta tillvägagångssätt för vätskekromatografi-masspektrometri (LC-MS/MS) inkluderade en sannolikhetspoäng, eller en "Ascore", som mäter sannolikheten för ett korrekt fosforyleringsställe genom att mäta närvaron av specifika joner som indikerar fosforyleringsställen på en peptidsekvens . Med denna metod kunde forskare vid Cell Signaling Technology generera pY-antikroppar som fungerar för att dra ner fosforylerade tyrosinrester genom immunutfällning .

Rikova använde denna fosfoproteomiska teknik med vävnadsprover från patienter med icke-småcellig lungcancer (NSCLC) och fann överskott av fosforylering i tumörcellinjerna och undersökte tyrosinkinassignalering i dessa cancerlinjer. Tyrosinkinasreceptorer presenterar förmodade diagnostiska mål eftersom de själva fosforyleras vid tyrosinrester vid aktivering, vilket indikerar att receptorn är aktiv. Analys av NSCLC-vävnadsprover identifierade onkogena tyrosinkinaser baserat på deras fosforyleringsprofil och identifierade de nya ALK- och ROS-fusionsproteinerna i NSCLC. För att bestämma den genetiska profilen för dessa proteiner utförde Rikova RT-PCR och upptäckte att ALK fusionerades till EML4, ett mikrotubuliprotein, vilket utlöste evig aktivering av ALK-tyrosinkinaset. Hon föreslog att en coiled-coil-domän sammansmält med kinasdomänen av ALK sannolikt kommer att tillåta oligomerisering och följaktligen konstitutiv aktivering av ALK-kinas i dessa cancertyper. På liknande sätt bestämdes ROS-tyrosinkinaset vara fuserat till SLC34A2, ett transmembranbärarprotein, så att den N-terminala domänen av SLC34A2 fuseras till transmembrandomänen i ROS, som också visade sig ha konstitutiv aktivering.

Fokusering på cellsignalering och post-transkriptionella modifieringar (PTM) möjliggjorde denna nya screeningteknik som identifierar specifika onkogena mutationer hos patienter.

Mest citerade publikationer

• Rikova K, Guo A, Zeng Q, Possemato A, Yu J, Haack H, Nardone J, Lee K, Reeves C, Li Y, Hu Y. Global undersökning av fosfotyrosinsignalering identifierar onkogena kinaser vid lungcancer. Cell. 2007 Dec 14;131(6):1190-203. (open access) (citerat 2443 gånger, enligt Google Scholar )
• Guo A, Villén J, Kornhauser J, Lee KA, Stokes MP, Rikova K, Possemato A, Nardone J, Innocenti G, Wetzel R, Wang Y. Signaleringsnätverk sammansatta av onkogen EGFR och c-Met. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2008 jan 15;105(2):692-7. [2] (open access) (citerat 563 gånger, enligt Google Scholar. )
• Carretero J, Shimamura T, Rikova K, Jackson AL, Wilkerson MD, Borgman CL, Buttarazzi MS, Sanofsky BA, McNamara KL, Brandstetter KA, Walton ZE. Integrativa genomiska och proteomiska analyser identifierar mål för Lkb1-bristande metastaserande lungtumörer. Cancercell. 2010 juni 15;17(6):547-59. [3] (open access) (citerat 235 gånger, enligt Google Scholar. )