Junhyong Kim

Junhyong Kim är Edmund J. och Louise W. Kahns terminsbegåvade professor i biologi vid University of Pennsylvania och författare till över åttio publicerade vetenskapliga artiklar.

Karriär

Kim är specialiserad på beräkningsbiologi , genomik och evolutionsbiologi. Han kommer ursprungligen från Sydkorea och tog sin grundexamen i mikrobiologi vid Seoul National University . Under sina grundutbildningsår blev han starkt intresserad av datavetenskap och programmering. Han utvecklade ett program för att vika tRNA-sekvenser publicerade i Korean Journal of Biochemistry. Denna artikel är nu känd som den första beräkningsbiologiska artikeln publicerad i Korea. Han tog sin doktorsexamen i ekologi och evolution vid Stony Brook University 1992 under ledning av Lev Ginzburg och Dan Dykhuizen. Hans avhandling hade titeln "Faktorer som påverkar tillväxten av befolkningar och deras rumsliga fördelning." Hans postdoktorala forskning var med Margaret Kidwell vid University of Arizona som arbetade med molekylär utveckling av Drosophila-arter. 1994 blev han biträdande professor vid Institutionen för biologi vid Yale University och befordrades till en fast anställning 2000. 2002 flyttade han till University of Pennsylvania där han för närvarande är Edmund J. och Louise Kahns terminsbegåvade professor i Biology, adjungerad professor i datavetenskap och meddirektör för Penn Genome Frontiers Institute . Han har suttit i styrkommittén och konferensordföranden för Workshop on Algoritms in Bioinformatics ; programordförande och programkommitté för intelligenta system för molekylärbiologi ; och han är den äldsta Associate Editor för IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics . Junhyong Kims utmärkelser inkluderar Sloan Foundation Young Investigator Award, Yale Faculty Award, Visiting Fellow vid Newton Institute ( Cambridge University ) och IHES (Frankrike), Ellison Medical Foundation Senior Scholar in Aging och ett Guggenheim Fellowship .

Kim har arbetat med en mängd olika forskningsområden. Hans tidiga arbeten koncentrerades på matematisk fylogenetik, som började under hans forskarskola med Dr. Robert R. Sokal och F. James Rohlf som banade väg för beräkningsmetoder inom evolutionär trädskattning. Bland sina verk inom detta område introducerade Junhyong Kim användningen av algebraiska geometriska tekniker i fylogenetisk uppskattning. 1999, i samarbete med John Carlson vid Yale, utvecklade han en ny algoritm för beräkningsidentifiering av G-proteinkopplade receptorer (GPCR) utan att använda primär sekvenshomologi, vilket ledde till kloning av luktreceptorer i insekter. Efter hans flytt till Penn har hans forskning koncentrerats på jämförande funktionell genomik, särskilt genuttryck och RNA-biologi i två modellsystem. Inom ett område arbetar han med spirande jäst för att förstå mekanismerna och utvecklingen av timingkontroll för genuttryck. Inom det andra området arbetar han med James Eberwine för att förstå RNA-biologin hos däggdjursneuroner och utvecklingen av individuella cellegenskaper. Tillsammans med Dr. Eberwine hjälpte han till att utveckla en ny metod för att använda direkt RNA-överföring för att omprogrammera däggdjursceller och hjälpte till att dechiffrera mekanismerna för RNA-lokalisering i neuroner. På senare tid har Kim och Eberwine laboratorier arbetat tillsammans för att förstå transkriptomvariabilitet i enstaka celler och hur variationen relaterar till dysfunktion av celler. Drs. Kim och Eberwine leder för närvarande ett nytt 5-årigt projekt med ett anslag från National Institutes of Health .

externa länkar

• Junhyong Kims UPenn-webbplats