JUMPstart RNA-motiv
| JUMPstart RNA | |
|---|---|
 Konsensus sekundär struktur för JUMPstart RNAs
| |
| identifierare | |
| Symbol | JUMPstart RNA |
| Rfam | RF01707 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Cis -reglerande element |
| Domän(er) | Bakterie |
| PDB- strukturer | PDBe |
JUMPstart RNA-motivet beskriver en konserverad RNA -baserad sekundär struktur associerad med JUMPstart-element. JUMPstart-sekvensen med 39 baspar beskriver ett konserverat element uppströms om gener som deltar i polysackaridsyntes . JUMPstart-elementet har visat sig fungera som ett RNA och finns i de 5'-otranslaterade regionerna av generna som det reglerar.
JUMPstart-sekvenser inkluderar ett ops-element, som är en akronym för "operon-polarity suppressor" och har nukleotidkonsensus GGCGGUAG . Ops-elementet verkar i samverkan med RfaH- proteinet för att förbättra transkriptionen av gener nedströms om ops-elementet, särskilt gener långt borta inom långa operoner .