Intern slinga
Interna loopar (även kallade inre loopar) i RNA finns där det dubbelsträngade RNA:t separeras på grund av ingen Watson-Crick-Franklin-basparning mellan nukleotiderna . Interna loopar skiljer sig från Stem-loopar eftersom de förekommer i mitten av en sträcka av dubbelsträngat RNA. De icke-kanoniska resterna resulterar i att den dubbla helixen blir förvrängd på grund av avlindning, avstapling och kinking.
Interna slingor kan klassificeras som antingen symmetriska eller asymmetriska, med vissa asymmetriska interna slingor, även kända som utbuktningar. Många viktiga strukturella motiv är sammansatta av inre slingor som C-loopen, dockningsarmbågen, kink-turns (k-turn), den räta vinkeln, sarcin/ricin-öglorna (även kallade bulged-G-motiv), twist-up-motiv och UAA/GAN-intern loop-motiv.
|
Galleri med RNA-motiv som är värd för interna loopar
| |
|---|---|
|
![A consensus secondary structure and primary sequence for the 3` Sarcin-Ricin (or bulged-G) RNA motif.[6]](https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Sarcin-ricin-1-secondary-structure.svg)
![A consensus secondary structure and primary sequence for the 5` Sarcin-Ricin (or bulged-G) RNA motif.[6]](https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Sarcin-ricin-2-secondary-structure.svg)
![A consensus secondary structure and primary sequence for the twist-up RNA motif.[9]](https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Twist_up-secondary-structure.svg)
![A consensus secondary structure and primary sequence for the UAA-GAN RNA motif.[10]](https://commons.wikimedia.org/wiki/File:UAA_GAN-secondary-structure.svg)