IMES-2 RNA-motiv

Konsensus sekundär struktur av IMES-2 RNA. Denna siffra är anpassad från kompletterande data från en tidigare publikation.

Förutspådd IMES-2 RNA sekundär struktur i alphaproteobacterium HIMB114. Nukleotiderna numreras med början vid 5′-änden. Linjer märkta "0 nt" innehåller inga nukleotider.

IMES -2 RNA-motivet är en konserverad RNA- struktur som identifierades av en studie baserad på metagenomik och bioinformatik , och de underliggande RNA-sekvenserna identifierades oberoende av en liknande tidigare studie. Dessa RNA finns i miljösekvenser , och när de upptäcktes var de inte kända för att vara närvarande i någon odlad art . Ett IMES-2-RNA har dock detekterats i alphaproteobacterium HIMB114, som är klassificerat i SAR11-kladen av marina bakterier . Detta fynd stämmer överens med tidigare förutsägelser om att arter som använder IMES-2 RNA är närmast släkt med alfaproteobakterier . IMES-2-RNA är exceptionellt rikligt, eftersom dubbelt så många IMES-2-RNA hittades som ribosomer i RNA-prov från Stilla havet . Endast två bakteriella RNA är kända ( 6S RNA och transfer RNA ) för att vara mer transkriberade än ribosomer.

Den sekundära IMES-2 RNA-strukturen innehåller fyra stam-loop- strukturer och en pseudoknot .