Havssköldpadda tornovirus 1

Havssköldpadda tornovirus 1
Virusklassificering
Grupp:	Grupp II ( ssDNA )
Arter:	Havssköldpadda tornovirus 1

Havssköldpadda tornovirus 1 är ett enkelsträngat DNA-virus som isolerades från en sköldpadda med fibropapillomatos 2009.

Virologi

Genomet är cirkulärt och ~1,8 kilobaser långt med en G+C- halt på ~50%. Den har minst tre öppna läsramar (ORF 1, 2, 3) och två andra (ORF 4 och 5) kan också vara närvarande. Genomet har negativ polaritet.

ORF 1 har en förmodad nukleär lokaliseringssignal vid sin N-terminal. ORF 2 har viss homologi med det virala proteinet 2 från kycklinganemivirus. ORF 3 har ingen homologi med något känt protein. På liknande sätt har varken ORF 4 eller 5 någon homologi med något känt protein. Funktionerna hos dessa proteiner är inte kända.

En TATA-box (sekvens—TATAAA) och en polyadenosinsignal ( sekvens—AATAAA) finns i genomet.

Taxonomi

Den slutliga klassificeringen av detta virus har ännu inte beslutats.

Det har en låg nivå av homologi med Circovirus kycklinganemivirus .

Klinisk

Viruset kan isoleras från blodet och alla större organ samt fibropapillom.

Genomsekvenser

Lista: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore?term=EU867816:EU867824 [pacc]