Halocin

Halociner är bakteriociner som produceras av halofila Archaea och en typ av arkeocin .

Sedan deras upptäckt 1982 har halociner visat sig vara olika på liknande sätt som de andra bakteriocinerna. Vissa är stora proteiner, andra små polypeptider (mikrohalociner). Denna mångfald är förvånande av ett antal anledningar, inklusive de ursprungliga antagandena att Archaea, särskilt extremofiler, lever i relativt låga tätheter under förhållanden som kanske inte kräver antagonistiskt beteende.

Genetiken, produktionsmekanismen och verkningsmekanismen för halocinerna har studerats, men inte uttömmande. Halocinernas ekologi har också undersökts. En intressant observation är att halocinerna är aktiva över de stora avdelningarna av archaea, vilket bryter mot dogmen att de bör vara mest effektiva mot de närmast besläktade stammarna.

Halociner är särskilt intressanta på grund av hur de porbildande bakteriocinerna har använts för att undersöka cellmembranstrukturen och produktionen och upprätthållandet av energiska jongradienter över membranet. Halofilerna lever vid så extrema jonkoncentrationer att de representerar en uppsättning ovanliga lösningar och anpassningar med hänsyn till deras energigradienter. Möjligheten att använda inhemska halociner för att studera dessa gradienter ger en motivation för deras karakterisering.

De kan ha en roll i humanmedicin.

De finns också i många av de arter som används för att lära sig om halofiler i allmänhet.

Liksom andra bakteriociner är halocinerna under utredning som antimikrobiella medel för användning vid kontroll av förstörelse under industriella processer; i detta fall lädertillverkning.

Eftersom litteraturen om halociner är relativt begränsad kan den citeras uttömmande. Flera gånger har de tagits upp i bokkapitel.

BACTIBASE-databasen är en öppen databas för bakteriociner inklusive halociner ( se fullständig lista) .