HAND-domän
| HAND- | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 nukleosomigenkänningsmodul för iswi-
| |||||||||
| atpasidentifierare | |||||||||
| Symbol | HAND | ||||||||
| Pfam | PF09110 | ||||||||
| InterPro | IPR015194 | ||||||||
| SCOP2 | 1ofc / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Inom molekylärbiologi är HAND-domänen en proteindomän som antar en sekundär struktur bestående av fyra alfa-helixar , varav tre (H2, H3, H4) bildar en L-liknande konfiguration. Helix H2 löper antiparallellt med helixarna H3 och H4 och packar tätt mot helixen H4, medan helixen H1 vilar i den konkava ytan som bildas av dessa tre helixar och löper vinkelrätt mot dem. Denna domän ger DNA- och nukleosombindande egenskaper till proteinerna där den förekommer. Den heter HAND-domänen eftersom dess 4-spiralformade struktur liknar en öppen hand.
HAND-domän-innehållande proteiner inkluderar proteiner som är involverade i nukleosomremodellering , en energiberoende process som förändrar histon -DNA-interaktioner inom nukleosomer, och därigenom gör nukleosomalt DNA tillgängligt för regulatoriska faktorer. ATPaserna som är involverade i nukleosomremodellering tillhör SWI2/SNF2-underfamiljen av DEAD / H- helikaser , som innehåller en konserverad ATPas-domän som kännetecknas av sju motiv . Proteiner inom denna familj skiljer sig åt med avseende på domänorganisation, deras associerade proteiner och det ombyggnadskomplex där de finns. ATPase ISWI är en medlem av denna familj. ISWI kan delas in i två regioner: en N-terminal region som innehåller SWI2/SNF2 ATPas-domänen och en C-terminal region som är ansvarig för substratigenkänning . Den C-terminala regionen innehåller 12 alfa-helixar och kan delas in i tre domäner och en spacer-region: en HAND-domän, en SANT-domän (c-Myb DNA-bindande liknande), en spacer-helix och en SLIDE-domän (SANT- gillar men med flera infogningar).