Guanintetrad
Vänster: En guanintetrad med en central katjon Höger: Tre guanintetrader som bidrar till strukturen av en G-quadruplex
Inom molekylärbiologi är en guanintetrad (även känd som en G-tetrad eller G-kvartett ) en struktur som består av fyra guaninbaser i en kvadratisk plan array . De bidrar mest framträdande till strukturen av G-quadruplexes , där deras vätebindning stabiliserar strukturen. Vanligtvis finns det minst två guanintetrader i en G-quadruplex, och de har ofta vätebindning i Hoogsteen-stil .
Guanintetrader bildas av sekvenser rika på guanin, såsom GGGGC. De kan också spela en roll i dimeriseringen av icke-endogena RNA för att underlätta replikeringen av vissa virus. Guanintetrader dimeriseras genom sina 5'-ändar eftersom det är mer energimässigt gynnsamt .
De kan stabiliseras av centrala katjoner , såsom litium, natrium, kalium, rubidium eller cesium . Men de bildar fortfarande en mängd olika strukturer. Guanintetrader är inte alltid stabila, men sockerfosfatryggraden i DNA kan hjälpa till med stabiliteten hos själva guanintetraderna. Guanintetrader är mer stabila när de staplas, eftersom intermolekylära krafter mellan varje lager hjälper till att stabilisera dem.
Guanintetrader kan också påverka rekombination , replikation och transkription. Till exempel finns guanintetrader i promotorregionen av Myc -familjen av onkogener . De fungerar också vid byte av immunglobulinklass och kan spela en roll i HIV- genomet . Guanintetrader förekommer ofta i de telomera områdena av DNA.