Glyoxylat- och dikarboxylatmetabolism

Glyoxylat- och dikarboxylatmetabolism beskriver en mängd olika reaktioner som involverar glyoxylat eller dikarboxylater . Glyoxylat är den konjugerade basen av glyoxylsyra , och inom en buffrad miljö med känt pH som cellcytoplasman kan dessa termer användas nästan omväxlande, eftersom vinsten eller förlusten av en vätejon är allt som skiljer dem åt, och detta kan inträffa i vattenmiljön när som helst . Likaså är dikarboxylater konjugatbaserna av dikarboxylsyror , en allmän klass av organiska föreningar som innehåller två karboxylsyragrupper, såsom oxalsyra eller bärnstenssyra .

En kompakt grafisk beskrivning av större biokemiska reaktioner som är involverade finns på KEGG . Denna ger information om relevanta enzymer och detaljer om förhållandet till flera andra metaboliska processer: glycin-, serin- och treoninmetabolism som ger hydroxipyruvat och glyoxylat , purinmetabolism som ger glyoxylat, pyruvatmetabolism som ger (S)-malat och formiat , kolfixering som förbrukar 3-fosfo-D-glycerat och ger D -ribulos 1,5-P2, askorbat- och aldaratmetabolism som delar tartronat-semialdehyd, kvävemetabolism som delar formiat , pyruvatmetabolism och citratcykeln som delar oxaloacetat och vitamin B6 _metabolism som förbrukar glykolaldehyd .

Glyoxylatcykeln beskriver en viktig delmängd av dessa reaktioner involverade i biosyntes av kolhydrater från fettsyror eller tvåkolsprekursorer som kommer in i systemet som acetyl - koenzym A . Dess avgörande enzymer är isocitratlyas och malatsyntas . Emellertid har alternativa vägar föreslagits i organismer som saknar isocitratlyas.