Genomiskt urval

Genomisk selektion (GS) förutsäger avelsvärdena för en avkomma i en population genom att associera deras egenskaper (dvs. resistens mot skadedjur) med deras genetiska markörpoäng med hög täthet. GS är en metod som föreslås för att ta itu med brister i markörassisterad selektion ( MAS) i avelsprogram. GS är dock en form av MAS som skiljer sig från den genom att samtidigt uppskatta alla genetiska markörer, haplotyper eller marköreffekter längs hela genomet för att beräkna värdena för genomiska skattade avelsvärden (GEBV). Möjligheten med GS är att förklara den genetiska mångfalden i ett avelsprogram genom en hög täckning av genomomfattande markörer och att bedöma effekterna av dessa markörer för att förutsäga avelsvärden.

MAS-begränsningar

I motsats till MAS och dess fokus på ett fåtal signifikanta markörer, undersöker GS tillsammans alla markörer i en population. Sedan det första förslaget från GS för tillämpning i avelspopulationer har det dykt upp som en lösning på bristerna hos MAS.

MAS har presenterat två huvudsakliga begränsningar i avelstillämpningar. För det första används de bi-parentala kartläggningspopulationerna för de flesta QTL-analyser , vilket begränsar deras noggrannhet. Detta representerar ett problem eftersom en enskild bi-parental population inte kan representera allelisk mångfald och genetiska bakgrundseffekter i en avelspopulation.

Dessutom har polygena egenskaper (eller komplexa egenskaper) som kontrolleras av flera småeffektsmarkörer varit ett otroligt krångel för MAS. De statistiska metoder som används för att identifiera målmarkörer och implementera MAS för förbättring av polygena egenskaper har misslyckats.