Faustovirus
|
|
| Faustovirus | |
|---|---|
| Kryoelektronmikroskopi rekonstruktion av Faustovirus, från | |
| virusklassificering | |
| Grupp: |
Grupp I ( dsDNA )
|
| Familj: | |
| Släkte: |
Faustovirus
|
Faustovirus är ett släkte av jättevirus som infekterar amöbor associerade med människor. Viruset isolerades första gången 2015 och visade sig vara cirka 0,2 mikrometer i diameter med ett dubbelsträngat DNA- genom på 466 kilobaser som förutspåddes koda för 451 proteiner. Även om de klassificeras som ett nukleocytoplasmatiskt stort DNA-virus (NCLDV), delar faustovirus mindre än en fjärdedel av sina gener med andra NCLDV; dock är ~46% homologa med bakteriegener och resten är föräldralösa gener (ORFans). Specifikt är genen som kodar för huvudkapsidproteinet ( MCP) av faustovirus annorlunda än den för dess närmast besläktade jättevirus, asfivirus , såväl som andra NCLDVs. I asfivirus är genen som kodar för MCP ett enda genomiskt fragment av ~2000 baspar (bp), men i faustovirus kodas MCP av 13 exoner separerade av 12 stora introner . Exonerna har en medellängd på 149 bp och intronerna har en medellängd på 1 273 bp. Närvaron av introner i faustovirusgener är mycket ovanligt för virus.
Replikering
Replikationsstrategin för faustovirus i amöbor liknar den för mimivirus . Replikationscykeln som varar 18 till 20 timmar börjar med att amöban får i sig individuella viruspartiklar genom en process som kallas fagocytos . Efter cirka 2 till 4 timmar efter infektion internaliseras viruspartiklar via fagocytiska vakuoler och detekteras av värden. Även om partiklarna uppträder nära värdens kärna, finns det inga bevis för att viruset finns i kärnan eller har en interaktion med kärnmembranet. I likhet med mimiviruset, där en kanal skapas för partikelproteiner och DNA att färdas genom, tömmer faustoviruspartiklarna sina inre fack in i amöbans cytoplasma . I båda virusen leder fusionen till en förmörkelsefas där innehållet av partiklar blir osynligt inuti värdens cytoplasma. Emellertid är förmörkelsefasen av faustoviruset längre än mimiviruset och äger rum från 4 till 6 timmar efter infektion. Kännetecknad av en förlust av dess sfäriska form och en minskning av ytarea, genomgår amöbanvärdcellen en omorganisation, så att 8 till 10 timmar efter infektion finns det nya partiklar i en region som bildar en munkform. Denna region är den virala fabriken ; den är skild från kärnan och är omgiven av mitokondrier . Mellan 12 och 18 timmar efter infektion tar virusfabriken upp hela cytoplasman, som är helt fylld med nya viruspartiklar. 18 till 20 timmar efter infektion frigörs viruspartiklarna genom cellys .
Patogenicitet
Faustovirus påverkar amöba associerade med den mänskliga miljön, som Vermamoeba vermiformis ; denna speciella amöba har hittats i sjukhusvattennät, dricksvatten, mänskliga avföringsprover och kontaktlinser från keratitpatienter , så det kan vara ett möjligt bärande medel för virus. Faustovirus har hittats i avloppsvatten från olika geografiska platser, såsom Senegal, Frankrike, Libanon och Saudiarabien. Isolerade stammar av viruset har upptäckts hos gnagare, nötkreatur, febrila och friska människor samt brunnsvatten och floder. Även om faustovirus hittades hos människor är det okänt om det har en patogen effekt på människor; mer forskning krävs för att fastställa smittsättet och eventuella konsekvenser av infektion.