Ektopisk rekombination

Ektopisk rekombination är en atypisk form av rekombination där överkorsning sker vid icke-homologa, snarare än längs homologa, loci . //Detta måste redigeras, eftersom det är 1) felaktigt och 2) motsäger det som står nedan, nämligen behovet av ~2kbp homolog sekvens (vilket är korrekt). Rekommenderad ändring: ersätt "icke-homolog" med "icke-allelisk"// Sådan rekombination resulterar ofta i dramatisk kromosomförändring , vilket i allmänhet är skadligt för organismen. Viss forskning har dock föreslagit att ektopisk rekombination kan resultera i muterade kromosomer som gynnar organismen. Ektopisk rekombination kan inträffa under både meios och mitos , även om det är mer troligt att det inträffar under meios. Det förekommer relativt ofta - hos minst en jästart ( Saccharomyces cerevisiae ) är frekvensen av ektopisk rekombination ungefär i nivå med den för allelisk (eller traditionell) rekombination. Om allelerna vid två loci är heterozygota , är det relativt sannolikt att ektopisk rekombination inträffar, medan om allelerna är homozygota kommer de nästan säkert att genomgå allelisk rekombination. Ektopisk rekombination kräver inte inblandade loci för att vara nära varandra; det kan förekomma mellan loci som är vitt åtskilda på en enda kromosom, och har till och med varit känt att förekomma över kromosomer. Det kräver inte heller höga nivåer av homologi mellan sekvenser - den nedre gränsen som krävs för att den ska inträffa har uppskattats till så låg som 2,2 kb homologa sträckor av DNA- nukleotider .

Rollen av transponerbara element i ektopisk rekombination är ett område för aktiv undersökning. Transposerbara element - repetitiva sekvenser av DNA som kan infoga sig själva i vilken del av genomet som helst - kan uppmuntra ektopisk rekombination vid upprepade homologa sekvenser av nukleotider. Enligt en föreslagen modell kan emellertid ektopisk rekombination fungera som en hämmare av höga antal kopior av transposerbara element. Frekvensen av ektopisk rekombination av transponerbara element har kopplats till både högre antal kopior av transposerbara element och de längre längderna av dessa element. Eftersom ektopisk rekombination i allmänhet är skadlig, väljs allt som ökar dess odds att inträffa, inklusive de tidigare nämnda högre kopiantalet och längre längder. Denna modell kan emellertid endast tillämpas på enstaka familjer av transposerbara element i genomet, eftersom sannolikheten för ektopisk rekombination som inträffar i en TE-familj är oberoende av att den förekommer i en annan. Det följer att transposerbara element som är kortare, transponerar sig själva mindre ofta och har mutationshastigheter som är tillräckligt höga för att störa homologin mellan transposerbara elementsekvenser tillräckligt för att förhindra ektopisk rekombination från att inträffa.