David W. Deamer

David W. Deamer Ph.D.
Född	( 1939-04-21 ) 21 april 1939 Santa Monica, CA
Nationalitet	amerikansk
Ockupation	Biolog
Utmärkelser	Guggenheim Fellow , 1985
Akademisk bakgrund
Utbildning	Duke University ( B.Sc. 1961) Ohio State University ( Ph.D. 1965)
Alma mater	Ohio State University
Avhandling	Effekten av alkaliska jordartsmetalljoner på fettsyra- och fosfolipidmonoskikt ( 1965)
Doktorand rådgivare	David Cornwell
Akademiskt arbete
Disciplin	Biofysiker
institutioner	University of California, Santa Cruz
Anmärkningsvärda idéer	nanopore-sekvensering

David Wilson Deamer (född 21 april 1939) är en amerikansk biolog och forskningsprofessor i biomolekylär teknik vid University of California, Santa Cruz . Deamer har gjort betydande bidrag till området membranbiofysik. Hans arbete ledde till en ny metod för DNA-sekvensering och en mer fullständig förståelse av membranens roll i livets uppkomst .

Han tilldelades ett Guggenheim Fellowship 1985, som stödde forskning vid Australian National University i Canberra för att undersöka organiska föreningar i Murchison-meteoriten . Han var ordförande för International Society for the Study of the Origin of Life från 2013 till 2014. [

Tidigt liv

Deamers far, även David, arbetade på Douglas Aircraft i Santa Monica, Kalifornien , under och efter andra världskriget medan hans mamma Zena tog hand om Deamer och hans två bröder, Richard och John. 1952 flyttade familjen till Ohio , där de tre bröderna gick på Westerville High School. 1957 lämnade Deamer in sin forskning om självorganiserande protozoer till Westinghouse Science Talent Search och var bland de 40 vinnare som bjöds in till Washington DC det året. Han tilldelades ett fullständigt stipendium till Duke University, där han avslutade en kandidatexamen i kemi 1961.

Forskning

Som ung professor vid UC Davis fortsatte Deamer att arbeta med elektronmikroskopi och avslöjade för första gången partiklar relaterade till funktionella ATPase-enzymer i membranen av sarkoplasmatiskt retikulum. Efter att ha tillbringat sabbatsår i England vid University of Bristol 1971 och med Alec Bangham 1975, blev Deamer intresserad av liposomer . Samtal med Bangham inspirerade hans forskning om membranens roll i livets uppkomst, och 1985 visade Deamer att Murchisons kolhaltiga meteorit innehöll lipidliknande föreningar som kunde samlas till membranösa vesiklar. Deamer beskrev betydelsen av självmonteringsprocesser i sin bok First Life från 2011 . I samarbete med Mark Akeson, en dåvarande postdoktorand, etablerade de två metoderna för att övervaka protonpermeation genom jonkanaler som gramicidin. 1989, när han återvände från ett vetenskapligt möte i Oregon, tänkte Deamer att det kunde vara möjligt att sekvensera enstaka molekyler av DNA genom att använda en pålagd spänning för att dra dem individuellt genom en nanoskopisk kanal. DNA-sekvensen kunde särskiljas genom den specifika moduleringseffekten av de fyra baserna på jonströmmen genom kanalen. 1993 inledde han och Dan Branton ett forskningssamarbete med John Kasianowitz vid NIST för att undersöka denna möjlighet med hemolysinkanalen och publicerade 1996 det första dokumentet som visar att nanoporesekvensering kan vara genomförbar. George Church vid Harvard hade självständigt föreslagit en liknande idé, och Church, Branton och Deamer beslutade att inleda en patentansökan som tilldelades 1998. Mark Akeson anslöt sig till forskningssatsningen 1997 och publicerade 1999 en artikel som visade att hemolysinkanalen, nu hänvisad till som en nanopore , kunde skilja mellan purin- och pyrimidinbaser i enstaka RNA-molekyler. 2007 Oxford Nanopore Technologies (ONT) patenten som beskriver tekniken och släppte 2014 MinION nanopore-sekvenseringsenheten till utvalda forskare. De första publikationerna dök upp 2015, varav en använde MinION för att sekvensera E. coli-DNA med 99,4 % noggrannhet i förhållande till det etablerade genomet på 5,4 miljoner baspar. Trots tidigare skepsis accepteras nu nanopore-sekvensering som en gångbar tredje generationens sekvenseringsmetod .

Andra publikationer

Deamer är också medförfattare tillsammans med vetenskapsförfattaren Wallace Kaufman till en sci-fi-roman, The Hunt for FOXP5: A Genomic Mystery Novel (Springer, 2016). Genom karaktärer från amerikanska universitet och kazakstansk vetenskap och politik utforskar författarna den etiska komplexiteten i att redigera mänskliga gener.