Cirkulärt virus i samband med bovin avföring

Bovin avföring associerad cirkulär virus
Klassificering av virus
Grupp:	Grupp II ( ssDNA )

Bovint avföringsassocierat cirkulärt virus är ett enkelsträngat DNA-virus med ett cirkulärt genom som isolerades från bovin avföring. Den har också isolerats från grisavföring. Därför porcint avföringsassocierat cirkulärt virus , en föreslagen art som ännu inte accepterats av ICTV , vara en synonym.

Virologi

Detta virus isolerades från kor och grisar som verkade vara friska.

Genom

Genomet är en enkelsträngad cirkulär DNA-molekyl med en längd på 2600 baser. Den har två öppna läsramar som kodar för ett replikas och kapsidprotein . Läsramarna är ordnade i motsatta riktningar på genomet. En stamslinga finns mellan 3'-ändarna av de öppna läsramarna. Detta är som schimpansavföringsassocierat cirkulärt virus och till skillnad från något annat känt cirkulärt DNA-virus.

Taxonomi

Detta virus verkar bilda en kladd med det cirkulära viruset associerat med schimpansavföring . Deras förhållande till andra virus är ännu inte känt. De närmaste släktingarna verkar vara Nanoviridae men ytterligare arbete krävs för att klargöra denna punkt.

Emellertid verkar svinavföringsassocierat cirkulärt virus vara en oklassificerad medlem av ICTV-accepterat släkte Porprismacovirus i familjen Smacoviridae , samma som schimpansavföringsassocierat cirkulärt virus . Nanoviridae och Smacoviridae är båda medlemmar av klassen Arfiviricetes .