Charles Ofria
Charles Ofria | |
---|---|
Född |
New York, NY (USA)
|
13 december 1973
Medborgarskap | Förenta staterna |
Alma mater |
Stony Brook University (BS, 1994) California Institute of Technology (Ph.D., 1999) |
Känd för | Digital evolution , Avida |
Utmärkelser |
Withrow Distinguished Scholar Award (2006, 2016) NSF CAREER Award (2007) Withrow Teaching Excellence Award (2010) |
Vetenskaplig karriär | |
Fält | Datavetenskap, Evolutionsbiologi |
institutioner | Michigan State University |
Doktorand rådgivare | Christoph Adami |
Andra akademiska rådgivare | Richard Lenski |
Hemsida |
Dr Charles A. Ofria är professor vid avdelningen för datavetenskap och teknik vid Michigan State University , chef för Digital Evolution (DEvo) Lab där och chef för BEACON Center for the Study of Evolution in Action. Han är son till avlidne Charles Ofria, som utvecklade det första helt integrerade butikshanteringsprogrammet för bilreparationsindustrin. Ofria gick på Stuyvesant High School och tog examen från Ward Melville High School 1991. Han fick en kandidatexamen i datavetenskap, ren matematik och tillämpad matematik från Stony Brook University 1994 och en doktorsexamen. i Computation and Neural Systems från California Institute of Technology 1999. Ofrias forskning fokuserar på samspelet mellan datavetenskap och darwinistisk evolution.
Ofria är en av designarna av Avida , en mjukvaruplattform för artificiellt liv för att studera den evolutionära biologin hos självreplikerande och utvecklande datorprogram ( digitala organismer , se även Digitala organismsimulatorer ). Avida har använts flitigt för att studera de grundläggande processerna som ligger till grund för darwinistisk evolution. Avida är under aktiv utveckling i Ofrias Digital Evolution Lab vid Michigan State University och designades ursprungligen av Ofria, Chris Adami och C. Titus Brown på Caltech 1993.
Högsta betyg
Ofria mottog NSF Career Award 2007 och Withrow Excellence Award for Excellence in Teaching 2010 och for Excellence in Research 2006 och 2016. Han vann även 2017 William J. Beal Outstanding Faculty Award.
Representativa tidskriftspublikationer
- Clune J, Pennock RT, Ofria C, Lenski RE (2012) Ontogeni tenderar att rekapitulera fylogeni i digitala organismer" The American Naturalist 180: E54–E63. ( pdf )
- Clune J, Goldsby HJ, Ofria C och Pennock RT (2011) Selektivt tryck för korrekt altruismmål: Bevis från digital evolution för svåra att testa aspekter av inkluderande fitnessteori. Royal Societys handlingar. 278: 666-674. ( PDF )
- Clune J, Stanley KO, Pennock RT, Ofria C (2011) Om utförandet av indirekt kodning över kontinuumet av regelbundenhet. IEEE-transaktioner på evolutionär beräkning. 15(3): 346-367. ( PDF )
- Clune J, Misevic D, Ofria C, Lenski RE, Elena SF och Sanjuán R. Naturligt urval misslyckas med att optimera mutationshastigheterna för långsiktig anpassning i robusta träningslandskap
- Ofria C, Huang W och Torng E. Om den gradvisa utvecklingen av komplexitet och det plötsliga uppkomsten av komplexa egenskaper
- Elena SF, Wilke CO, Ofria C och Lenski RE. Effekter av populationsstorlek och mutationshastighet på utvecklingen av mutationell robusthet
- Ostrowski E, Ofria C och Lenski RE, Ekologisk specialisering och adaptivt förfall i digitala organismer
- Lenski RE, Barrick JE, Ofria C. Balansering av robusthet och utvecklingsförmåga
- Misevic D, Ofria C och Lenski RE. Sexuell reproduktion omformar digitala organismers genetiska arkitektur
Utvalda vetenskapliga publikationer med Avida
- RE Lenski , C. Ofria, TC Collier, C. Adami (1999). Genomisk komplexitet, robusthet och genetiska interaktioner i digitala organismer. Nature 400: 661-664. Abstrakt
- C. Adami , C. Ofria och TC Collier (2000). Utveckling av biologisk komplexitet. "Proceedings of the National Academy of Sciences" 97 :4463-4468. Abstrakt
- CO Wilke, JL Wang, C. Ofria, RE Lenski och C. Adami (2001). Evolution av digitala organismer med hög mutationsfrekvens leder till överlevnad av de plattaste. Nature 412: 331-333 Sammanfattning .
- RE Lenski , C. Ofria, RT Pennock och C. Adami (2003). Det evolutionära ursprunget till komplexa funktioner. Nature 423: 139-145. Abstrakt
- SS Chow, CO Wilke, C. Ofria, RE Lenski och C. Adami (2004). Adaptiv strålning från resurskonkurrens i digitala organismer. Science 305: 84-86 Sammanfattning .