Catherine Feuillet

Catherine Feuillet
Född	Catherine Feuillet Juli 1965 (57 år) Orléans , Frankrike
Nationalitet	franska
Alma mater	Federal Institute for Agroecology i Zürich
Yrke	Genetiker och molekylärbiolog
Känd för	Sekvensering av kromosom 3B på vetegenomet
Utmärkelser	Prix ​​Foulon, Trophée de la Femme, Chevalier of the Legion of Honour, Jean Dufrenoy-priset från Académie d'Agriculture i Frankrike

Catherine Feuillet ( franskt uttal: [katʁin fœjɛ] ( lyssna ) ; född juli 1965) är en fransk genetiker som för närvarande är Chief Scientific Officer för Inari Agriculture , ett Cambridge MA-baserat bioteknikföretag. Feuillet har en doktorsexamen i växtmolekylärbiologi om isolering och karakterisering av gener involverade i träbildning i eukalyptusträd. Hon började arbeta med genetiken av sjukdomsresistens i vete 1994 under sina postdoktorala studier vid det schweiziska federala institutet för agroekologi . Hon flyttade sedan som juniorgruppledare till universitetet i Zürich där hon undersökte den molekylära grunden för svampresistens i vete och i korn och klonade den första lövrostresistensgenen från vete. 2004 anställdes hon som forskningschef vid Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) i Frankrike för att leda europeiska och internationella projekt om vetegenomik.

2008 publicerade hon och hennes team framgångsrikt den första kartläggningen av den största vetekromosomen, 3B och 2014 var de också de första att publicera hela sekvensen av denna kromosom samt en första referenssekvens av hela vetets genom tillsammans med International Wheat Genome Sequencing Consortium ( IWGSC ).

Feuillet var en del av de grundande medlemmarna och fungerade som medordförande för IWSGC från 2005-2018. 2013 gick hon med Bayer Crop Science, chef för egenskapsforskning, för att leda upptäckten och valideringen av gener för att förbättra skörden av sojabönor, bomull, raps och vete och toleransen mot biotiska påfrestningar. Hon hedrades som Chevalier of the Legion of Honor och har tilldelats Prix Foulon från den franska vetenskapsakademin, vetenskapspriset för Femmes en or och Jean Dufrenoy-priset från Académie d'Agriculture i Frankrike. Hon är en vald fellow i American Association for the Advancement of Science.

Utbildning och tidigt liv

Catherine Feuillet föddes i Orléans , cirka 130 km (80 miles) söder om Paris , växte upp nära Paris och genomförde sina universitetsstudier i Toulouse i växtmolekylärbiologi . 1993 tog hon sin doktorsexamen vid Paul Sabatier University i Toulouse , om gener involverade i lignifiering i Eucalyptus. Mellan 1994 och 1997 avslutade hon postdoktorala studier vid Federal Institute for Agroecology i Zürich , och utvecklade molekylära markörer för att stödja avel för svampresistens i vete. Under sin postdoc började hon arbeta med vetegenomik och fortsatte att utveckla sjukdomsresistensgenkloning och jämförande genomikprojekt inom vete och knappt som juniorgruppledare och biträdande professor vid Institutet för växtbiologi vid universitetet i Zürich .

"On me dit que je fais peur aux gens en parlant de sélection de gènes... Mais je ne fais que ce que font les fermiers depuis dix mille ans! Sauf qu'ils le faisaient sans le savoir, par croisements. Maintenant, nous , på veut savoir." "De säger till mig att jag skrämmer folk genom att prata om genurval... Men jag gör bara det som bönder har gjort i tiotusen år. Förutom att de gjorde det, utan att veta om det, genom korsning. Nu vill vi veta [vad vi gör]."

Catherine Feuillet, citerad 2011

Universitetet i Zürich i Schweiz

Tidigare forskning och utmärkelser

2004 började hon på Institut National de la Recherche Agronomique (National Institute of Agricultural Research) (INRA) i Clermont-Ferrand , Frankrike, som forskningschef och biträdande chef för den gemensamma forskningsenheten för spannmålsgenetik, mångfald och ekofysiologi . 2005 var hon med och grundade International Wheat Genome Sequencing Consortium (IWGSC), en internationell satsning för att producera en högkvalitativ referenssekvens av brödvetegenomet, en vetenskaplig utmaning vid den tiden med tanke på att storleken på vetegenomet är 5 gånger större än mänskligt genom. 2005 var hon också med och skapade och utsågs till ordförande för European Triticeae Genomics Initiative (ETGI) som syftade till att samordna forskning inom vete, korn och råg i Europa och utveckla samarbetsprojekt. Mellan 2008 och 2012 ledde hon ett europeiskt projekt med titeln "TriticeaeGenome: Genomics for Triticeae improvement" som omfattade 17 offentliga och privata partners i nio länder som en del av FP7-ramverket. 2008 publicerade Feuillets team i tidskriften Science , de första kartläggningsresultaten av vetekromosomen 3B, som är den största av vetets 21 kromosomer. Samma år gick hon med i International Triticeae Mapping Initiative (ITMI) för att hjälpa till med planering och koordinering av forskningsprojekt. 2009 initierade och ledde hon Breedwheat, ett stort offentligt-privat partnerskap (27 partners) insatser i Frankrike för att stärka konkurrenskraften för den franska veteförädlingssektorn och möta samhällets krav på hållbarhet, kvalitet och säkerhet inom jordbruksproduktionen. Den 24 november 2009 fick Feuillet Prix Foulon från den franska vetenskapsakademin för sitt arbete med att dechiffrera genomet. Samma år tilldelades hon också guldet Trophée de la Femme för sin forskning och mottog sedan den 10 september 2010 insignierna Chevalier of the Legion of Honor från INRA.

2011 gick hon med i Wheat Initiative, skapat av G20-länderna för att förbättra den globala veteproduktionen och samma år belönades hon med ett Fellowship av American Association for the Advancement of Science. Feuillet fick Jean Dufrenoy-priset från Académie d'Agriculture i Frankrike 2012.

Efter att ha slutfört sekvensen kromosom 3B, den största vetekromosomen, med sitt team på INRA i samarbete med Genoscrop och CNRGV, en grundläggande prestation som publicerades i tidningen Science, gick Feuillet till Bayer CropScience som chef för Trait Research Department.

Vete genomsekvensering

Weizenähre Detailansicht

2004 när hon började på INRA som forskningschef började Feuillet sitt arbete med att sekvensera brödvetegenomet (16Gb, 21 kromosomer), med syftet att dekryptera den största vetekromosomen, 3B, som är 1Gb stor - storleken på hela sojagenomet och mer än dubbelt så stort som hela risgenomet. Den initiala strategin för IWGSC var att producera fysiska kartor över varje enskild kromosom och sekvensera dem för att komma till en referensgenomsekvens. Vid den tiden gav tillvägagångssätt för sekvensering av hela genom inte några sekvenssammansättningar av hög kvalitet på grund av den extremt höga mängden repetitiva sekvenser i vetegenomet. Feuillet och hennes team var de första att upprätta en fysisk karta över kromosom 3B som publicerades i tidskriften Science 2008. Detta banade väg för andra team att färdigställa fysiska kartor över de andra 20 kromosomerna. Under 2014 publicerades referenssekvensen för kromosom 3B av Feuillet och hennes team samtidigt med publiceringarna av ett utkast till sekvens av varje enskild kromosom av IWGSC, i tidskriften Science. Referenssekvensen för kromosom 3B avslöjade slående mönster av de mer än 8 000 genernas distribution längs kromosomen och en bättre förståelse av organisationen, funktionen och utvecklingen av stora och polyploida genom som vete. Utkastsekvensen för de 21 kromosomerna möjliggjorde för första gången annotering av 124 201 gener och jämförande evolutionära analyser med diploida och tetraploida vetesläktingar. Dessa sekvenser förankrade till många molekylära markörer på genetiska kartor, gav en språngbräda för snabbare genisolering, snabb utveckling av genetiska markörer och exakt förädling genom genomredigering för att påskynda veteförädlingen.

Efter ett genombrott av NRGene i förmågan att utföra sammansättning av mycket repetitiva sekvenser 2016, kombinerade IWGSC de fysiska kartbaserade sekvenseringsmetoderna och helgenomets sekvenseringsmetoder för att producera en första version av en högkvalitativ referenssekvens av brödvetegenomet. Detta publicerades 2018 tillsammans med andra publikationer som exemplifierar användningen av en sådan högkvalitativ sekvens inom Science. Sedan dess har mer än publikationer som hänvisar till användningen av IWGSC-referenssekvensen publicerats som visar användbarheten av en sådan sekvens, vilket uppfyller den vision som Feuillet och hennes kollegor vid IWGSC etablerade 2005.

Att sekvensera vetegenomet fullständigt är viktigt för producenter över hela världen. Vete utgör för närvarande mer än 20 % av alla kalorier som konsumeras i världen, och i takt med att den globala befolkningen ökar, ökar också behovet av vete. På senare tid har dock veteproduktionen stagnerat eftersom tekniska framsteg inte kan hålla jämna steg med negativa ekonomiska och naturliga faktorer. Den totala efterfrågan på vete förväntas öka med 70 procent till år 2050 – en ökning med cirka 1,6 procent per år (Gonzalez). Sekvensering av genomet har gett en ovärderlig resurs för forskare för att påskynda förbättringen av vete och förmågan för vete att klara klimatförändringarna och produceras på ett hållbart och miljövänligt sätt genom avancerad förädling och teknologi.

Nuvarande forskning

Feuillet leder vetenskapsorganisationen vid Enare jordbruk som deras Chief Scientific Officer. Inaris vetenskapsorganisation består av cirka 70 anställda vid deras forskningsanläggningar i Gent, Belgien, Cambridge, Massachusetts och West Lafayette, Indiana. Feuillet och hennes team arbetar med att identifiera de regioner av de genom som ska redigeras, och med att utveckla en unik genomredigeringsverktygslåda som möjliggör förädling genom redigering av stora grödor som majs, sojabönor, vete och tomat för att få växtförädling till en ny ålder och lösa ett mycket komplext problem; snabbt skapa hundratals nya sorter som kommer att prestera optimalt i sin lokala miljö samtidigt som de kräver minimala naturresurser.